More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0359 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
327 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  91.74 
 
 
327 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.14 
 
 
324 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  70.28 
 
 
323 aa  464  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.11 
 
 
333 aa  455  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.91 
 
 
323 aa  454  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  70.59 
 
 
335 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.08 
 
 
327 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 
327 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  68.11 
 
 
330 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.87 
 
 
336 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  66.04 
 
 
340 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  67.8 
 
 
340 aa  429  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  70.19 
 
 
330 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 
329 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  66.36 
 
 
328 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.36 
 
 
329 aa  417  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  68.87 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  64.89 
 
 
325 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  65.64 
 
 
328 aa  414  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.31 
 
 
327 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.67 
 
 
326 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.92 
 
 
328 aa  404  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.2 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.2 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.2 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  61.29 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.94 
 
 
338 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  68.81 
 
 
332 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.85 
 
 
326 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 
326 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  67.08 
 
 
329 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  61.4 
 
 
344 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  63.44 
 
 
324 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  63.08 
 
 
328 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 
340 aa  363  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  59.08 
 
 
325 aa  358  7e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 
324 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.82 
 
 
341 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.07 
 
 
325 aa  332  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.11 
 
 
352 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.31 
 
 
324 aa  329  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.98 
 
 
322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.16 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.34 
 
 
341 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.34 
 
 
341 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.22 
 
 
326 aa  325  7e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  50.77 
 
 
328 aa  324  1e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.04 
 
 
341 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.35 
 
 
322 aa  322  5e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
327 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.35 
 
 
322 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.52 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.08 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.89 
 
 
326 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.73 
 
 
322 aa  318  5e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  50 
 
 
330 aa  315  5e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.94 
 
 
347 aa  315  6e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  52.92 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.23 
 
 
352 aa  312  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.1 
 
 
343 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.16 
 
 
323 aa  310  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.99 
 
 
324 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.41 
 
 
333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  52.28 
 
 
340 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
350 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
350 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.62 
 
 
326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.01 
 
 
325 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 
325 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.32 
 
 
325 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.65 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.24 
 
 
330 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.49 
 
 
317 aa  306  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.92 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  49.18 
 
 
336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 
326 aa  305  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.5 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
321 aa  305  9.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.56 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.5 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.5 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.02 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  48.56 
 
 
326 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.82 
 
 
337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
338 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.86 
 
 
336 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.61 
 
 
328 aa  302  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>