More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0620 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 326 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  67.41 
 
 		 323 aa  437  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.4 
 
 		 324 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.14 
 
 		 323 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  66.88 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  67.3 
 
 		 340 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  64.78 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.64 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  63.98 
 
 		 328 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  65.83 
 
 		 340 aa  404  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.65 
 
 		 333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  66.14 
 
 		 330 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.46 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  64.11 
 
 		 328 aa  398  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.66 
 
 		 323 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.78 
 
 		 327 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.66 
 
 		 323 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.66 
 
 		 323 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  66.99 
 
 		 330 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.17 
 
 		 329 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.74 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.67 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.26 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.99 
 
 		 326 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.99 
 
 		 326 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.16 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  59.65 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.04 
 
 		 327 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  63.95 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  62.12 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  63.04 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  63.29 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.04 
 
 		 340 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  62.42 
 
 		 329 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  61.49 
 
 		 332 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  56.57 
 
 		 325 aa  338  7e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.16 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 		 324 aa  311  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.93 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.8 
 
 		 325 aa  305  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  50.62 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.86 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.16 
 
 		 347 aa  302  4.0000000000000003e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.06 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.21 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.43 
 
 		 339 aa  301  9e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.74 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.25 
 
 		 321 aa  299  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.11 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  53.09 
 
 		 327 aa  298  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.84 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.58 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  47.19 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.94 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2986  Porphobilinogen synthase  49.24 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199631  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.27 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.71 
 
 		 326 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.62 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.25 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.95 
 
 		 338 aa  292  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0153691 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.07 
 
 		 338 aa  292  5e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.07 
 
 		 327 aa  292  5e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.34 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.63 
 
 		 324 aa  292  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.97 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.37 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.09 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.01 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.34 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.34 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.68 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.28 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.28 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  48.61 
 
 		 325 aa  288  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.15 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.98 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.46 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.24 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.24 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.34 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  42.19 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.69 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.85 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  47.35 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.97 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2737  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.1 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  43.07 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.55 
 
 		 325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.6 
 
 		 345 aa  282  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0284  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.11 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.06 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0393  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.11 
 
 		 324 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>