More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1709 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 338 aa  687    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0153691 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  82.25 
 
 		 338 aa  584  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  81.25 
 
 		 336 aa  565  1e-160  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  79.76 
 
 		 336 aa  555  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.87 
 
 		 347 aa  433  1e-120  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  56.97 
 
 		 336 aa  394  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.27 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.28 
 
 		 325 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  63.23 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 		 326 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  56.93 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  55.69 
 
 		 328 aa  355  5.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.17 
 
 		 324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.29 
 
 		 326 aa  349  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  59.74 
 
 		 327 aa  348  7e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.85 
 
 		 324 aa  348  9e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.35 
 
 		 326 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.32 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.85 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2986  Porphobilinogen synthase  55.35 
 
 		 348 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199631  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.08 
 
 		 326 aa  342  7e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.78 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.21 
 
 		 321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 		 321 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  55.72 
 
 		 330 aa  339  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.8 
 
 		 325 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.6 
 
 		 339 aa  338  8e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.65 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.7 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.64 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 		 324 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.82 
 
 		 327 aa  333  4e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.05 
 
 		 324 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 		 329 aa  332  8e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.48 
 
 		 322 aa  330  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 		 326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1400  Porphobilinogen synthase  56.71 
 
 		 345 aa  328  8e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.175511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.15 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.63 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  54.81 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.17 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.38 
 
 		 329 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.64 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.48 
 
 		 327 aa  325  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 		 356 aa  325  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.39 
 
 		 323 aa  325  5e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.08 
 
 		 333 aa  325  6e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 327 aa  325  7e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 315 aa  325  7e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  53.35 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.06 
 
 		 352 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.1 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.5 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.8 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.8 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.8 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.8 
 
 		 329 aa  322  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.8 
 
 		 329 aa  323  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.8 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 		 322 aa  322  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.5 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.8 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.92 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.71 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  49.54 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.2 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.92 
 
 		 325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.52 
 
 		 327 aa  319  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 327 aa  318  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  52.57 
 
 		 340 aa  318  7.999999999999999e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 324 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.41 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.41 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.89 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.89 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  50.15 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3449  Porphobilinogen synthase  48.62 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  53.01 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.33 
 
 		 327 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.58 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.58 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.82 
 
 		 324 aa  316  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.89 
 
 		 333 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  52.89 
 
 		 325 aa  316  5e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  51.96 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.54 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 331 aa  315  8e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  49.08 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>