More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6128 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
338 aa  666    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  82.32 
 
 
340 aa  494  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  75.93 
 
 
328 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.66 
 
 
327 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  74.61 
 
 
328 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.28 
 
 
329 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  73.54 
 
 
329 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.56 
 
 
324 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.24 
 
 
333 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  65.54 
 
 
323 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 
323 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  69.11 
 
 
329 aa  414  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  70.83 
 
 
332 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  66.14 
 
 
340 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  67.37 
 
 
344 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  64.94 
 
 
335 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.35 
 
 
326 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  64.62 
 
 
325 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.08 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.18 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.94 
 
 
327 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.35 
 
 
323 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.24 
 
 
336 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.35 
 
 
323 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.35 
 
 
323 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  61.82 
 
 
328 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  60.53 
 
 
351 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.66 
 
 
329 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  60.67 
 
 
330 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  63.38 
 
 
330 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  60.66 
 
 
340 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  63.32 
 
 
324 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.37 
 
 
326 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.52 
 
 
328 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.79 
 
 
327 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.67 
 
 
326 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.77 
 
 
326 aa  355  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  59.69 
 
 
325 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 
324 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.26 
 
 
352 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.62 
 
 
324 aa  339  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.65 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
341 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.06 
 
 
341 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 
326 aa  332  4e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.08 
 
 
326 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.53 
 
 
341 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 
326 aa  330  2e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.4 
 
 
347 aa  330  3e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
325 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 
322 aa  329  4e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
324 aa  328  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 
322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  53.4 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.91 
 
 
336 aa  326  3e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.39 
 
 
339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
339 aa  325  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  52.8 
 
 
330 aa  324  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.54 
 
 
324 aa  324  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 
337 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
325 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
326 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.3 
 
 
322 aa  324  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 
326 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 
325 aa  322  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  48.93 
 
 
336 aa  322  5e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.91 
 
 
322 aa  322  6e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.68 
 
 
315 aa  322  7e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  53.35 
 
 
330 aa  321  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52 
 
 
323 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.9 
 
 
317 aa  320  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.04 
 
 
326 aa  318  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52 
 
 
325 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.77 
 
 
322 aa  318  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.11 
 
 
335 aa  317  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
327 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
326 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.02 
 
 
336 aa  315  5e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
327 aa  315  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.99 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 
321 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  52.44 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 
330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.13 
 
 
343 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 
330 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.16 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.02 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2986  Porphobilinogen synthase  52.69 
 
 
348 aa  312  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199631  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
318 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 
325 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  54.91 
 
 
325 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  46.44 
 
 
325 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.12 
 
 
324 aa  309  5e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.89 
 
 
329 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.02 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.41 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.35 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>