More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4369 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  100 
 
 		 332 aa  665    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.54 
 
 		 327 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  73.85 
 
 		 328 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.28 
 
 		 329 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  71.43 
 
 		 344 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  66.56 
 
 		 323 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  74.38 
 
 		 329 aa  431  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.46 
 
 		 324 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.52 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  72.09 
 
 		 328 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.78 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.15 
 
 		 323 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  65.36 
 
 		 335 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  64.91 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  66.56 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.52 
 
 		 327 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.66 
 
 		 327 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.26 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.87 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  62.58 
 
 		 328 aa  397  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  67.1 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  67.08 
 
 		 329 aa  395  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 		 323 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  64.09 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  63.66 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.35 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.38 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.64 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.5 
 
 		 329 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.52 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.73 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  59.09 
 
 		 351 aa  378  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  60.43 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.8 
 
 		 324 aa  355  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.81 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.61 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 		 326 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.02 
 
 		 326 aa  352  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.61 
 
 		 341 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 327 aa  350  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.55 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.17 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.31 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.92 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  56.21 
 
 		 330 aa  348  5e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.55 
 
 		 322 aa  347  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.04 
 
 		 324 aa  346  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.46 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.18 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.68 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  58.93 
 
 		 324 aa  344  8.999999999999999e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.47 
 
 		 324 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 322 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.87 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.89 
 
 		 318 aa  344  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  52.94 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.78 
 
 		 323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  56.56 
 
 		 325 aa  341  8e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.32 
 
 		 335 aa  340  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 		 339 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.59 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.73 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  53.77 
 
 		 336 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.48 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  52.8 
 
 		 330 aa  333  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 		 346 aa  332  4e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.05 
 
 		 317 aa  333  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 		 334 aa  332  4e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.77 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 		 324 aa  332  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.85 
 
 		 336 aa  332  5e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.77 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.89 
 
 		 325 aa  330  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.15 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.04 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.04 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 		 321 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.7 
 
 		 327 aa  325  6e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 		 321 aa  325  6e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>