More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0252 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  100 
 
 		 325 aa  644    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.85 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  58.97 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  62.54 
 
 		 325 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.99 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  61.47 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  62.54 
 
 		 330 aa  371  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.31 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  61.56 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.37 
 
 		 329 aa  362  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.5 
 
 		 323 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.5 
 
 		 323 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.5 
 
 		 323 aa  358  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.44 
 
 		 329 aa  358  7e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  57.41 
 
 		 323 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  61.54 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 326 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  57.98 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.15 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  59.06 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.08 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.36 
 
 		 333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 326 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  56.56 
 
 		 351 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  59.82 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  60.19 
 
 		 329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.57 
 
 		 326 aa  338  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 327 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.87 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 338 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  57.06 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  60.26 
 
 		 332 aa  331  9e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  58.7 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.23 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.23 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.28 
 
 		 327 aa  317  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.56 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  58.41 
 
 		 328 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.82 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  53.56 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 		 322 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.84 
 
 		 341 aa  311  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.54 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.09 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  51.08 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.24 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.91 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 		 326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.73 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.6 
 
 		 322 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  56.25 
 
 		 324 aa  302  6.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 		 336 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.92 
 
 		 325 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.62 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.16 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.31 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.82 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.51 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.88 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.3 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 		 326 aa  298  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 		 329 aa  298  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.71 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  46.99 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.78 
 
 		 322 aa  297  2e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.01 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  52.29 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  50 
 
 		 325 aa  296  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.76 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.413701  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 		 328 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.97 
 
 		 317 aa  295  7e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.63 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.81 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0153691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.91 
 
 		 325 aa  292  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.31 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  50.62 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.19 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.89 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 325 aa  289  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.15 
 
 		 323 aa  289  4e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2529  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.57 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.02 
 
 		 325 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>