More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2765 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
327 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  86.24 
 
 
327 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.15 
 
 
328 aa  475  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.78 
 
 
323 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.85 
 
 
324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  67.8 
 
 
323 aa  455  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.5 
 
 
336 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  72.61 
 
 
330 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  66.15 
 
 
340 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  67.28 
 
 
340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  70.19 
 
 
330 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  66.15 
 
 
328 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  67.4 
 
 
325 aa  436  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.25 
 
 
323 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.25 
 
 
323 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.25 
 
 
323 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  66.15 
 
 
335 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.4 
 
 
333 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.23 
 
 
327 aa  418  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.58 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  67.38 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  62.87 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.26 
 
 
326 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.31 
 
 
327 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.11 
 
 
329 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.62 
 
 
327 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.27 
 
 
326 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.77 
 
 
326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  61.85 
 
 
328 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  63.12 
 
 
324 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  59.57 
 
 
344 aa  381  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  58.15 
 
 
325 aa  376  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  64 
 
 
328 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  62.07 
 
 
329 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  61.74 
 
 
332 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.79 
 
 
338 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.24 
 
 
340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.75 
 
 
352 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.07 
 
 
326 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
322 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
322 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
322 aa  335  5e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  50.15 
 
 
328 aa  335  7e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
325 aa  334  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48 
 
 
326 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.66 
 
 
324 aa  332  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.42 
 
 
327 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
326 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
324 aa  330  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.82 
 
 
347 aa  331  1e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  50 
 
 
330 aa  328  7e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.04 
 
 
327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.68 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 
330 aa  325  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 
330 aa  325  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.24 
 
 
326 aa  322  7e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.12 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.14 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.85 
 
 
325 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.62 
 
 
324 aa  318  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.69 
 
 
324 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.69 
 
 
324 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.94 
 
 
352 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.05 
 
 
329 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  51.1 
 
 
325 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
325 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 
318 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.12 
 
 
321 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
321 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.06 
 
 
325 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.31 
 
 
325 aa  316  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
336 aa  315  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 
329 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 
327 aa  315  8e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.49 
 
 
317 aa  315  9e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.55 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.69 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.37 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.76 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.46 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.07 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48 
 
 
326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  51.08 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.12 
 
 
341 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
338 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48 
 
 
325 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  45.34 
 
 
325 aa  312  5.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.46 
 
 
329 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.08 
 
 
329 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.77 
 
 
341 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.23 
 
 
327 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>