More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4577 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  100 
 
 		 344 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.98 
 
 		 327 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  70 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.07 
 
 		 329 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.63 
 
 		 324 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  64.33 
 
 		 323 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.72 
 
 		 323 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  71.65 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  69.33 
 
 		 328 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  68.47 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  64.22 
 
 		 325 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.4 
 
 		 327 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.67 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.27 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.35 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  61.4 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  60.35 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.12 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  63.86 
 
 		 330 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.25 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  61.7 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  60.46 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.64 
 
 		 329 aa  383  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  60.12 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.03 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.03 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.03 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.8 
 
 		 328 aa  381  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.4 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.88 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.3 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.01 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 		 326 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  59.76 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  62.15 
 
 		 329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.93 
 
 		 352 aa  359  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.63 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.78 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.09 
 
 		 322 aa  348  6e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.24 
 
 		 326 aa  348  8e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  57.06 
 
 		 325 aa  348  9e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  54.68 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.26 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.37 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.26 
 
 		 341 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 		 318 aa  346  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.57 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 321 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 321 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.71 
 
 		 324 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.66 
 
 		 324 aa  345  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.96 
 
 		 325 aa  345  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.45 
 
 		 325 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  55.11 
 
 		 325 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 324 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  57.14 
 
 		 324 aa  344  2e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 		 329 aa  342  5e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.79 
 
 		 322 aa  342  7e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 		 337 aa  341  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.44 
 
 		 325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.06 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.26 
 
 		 341 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.96 
 
 		 329 aa  338  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 322 aa  338  8e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  51.43 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.09 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.01 
 
 		 326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.21 
 
 		 331 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  52.74 
 
 		 330 aa  335  5.999999999999999e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.88 
 
 		 322 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 		 334 aa  335  7.999999999999999e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  50.91 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.02 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.37 
 
 		 326 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  51.52 
 
 		 330 aa  332  4e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.94 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  55.59 
 
 		 324 aa  332  6e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.94 
 
 		 326 aa  332  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.11 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.94 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.88 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.88 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  50.93 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.58 
 
 		 324 aa  330  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.67 
 
 		 322 aa  330  3e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>