More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2494 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  100 
 
 
324 aa  651    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  72.7 
 
 
328 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  67.16 
 
 
351 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.8 
 
 
327 aa  417  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  65.31 
 
 
340 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.22 
 
 
336 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.56 
 
 
324 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  65.62 
 
 
325 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.88 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  64.15 
 
 
323 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.3 
 
 
333 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  69.45 
 
 
330 aa  401  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.26 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  63.75 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  67.3 
 
 
329 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  62.62 
 
 
335 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.95 
 
 
326 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  62.66 
 
 
330 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.12 
 
 
327 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.62 
 
 
327 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.99 
 
 
329 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.38 
 
 
327 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.64 
 
 
327 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.56 
 
 
329 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.32 
 
 
338 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.8 
 
 
323 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.8 
 
 
323 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.8 
 
 
323 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.06 
 
 
326 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.87 
 
 
326 aa  359  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  60.19 
 
 
328 aa  358  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  59.06 
 
 
325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.07 
 
 
340 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  61.72 
 
 
328 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  57.14 
 
 
344 aa  342  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  62.25 
 
 
329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.52 
 
 
352 aa  332  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
324 aa  332  6e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  58.71 
 
 
332 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.16 
 
 
324 aa  319  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 
324 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
325 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.3 
 
 
321 aa  316  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.99 
 
 
321 aa  316  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.89 
 
 
341 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.92 
 
 
329 aa  315  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.3 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
329 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.16 
 
 
326 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.02 
 
 
326 aa  311  9e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.91 
 
 
323 aa  310  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
341 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  51.09 
 
 
330 aa  310  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.1 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.1 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  51.26 
 
 
330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.22 
 
 
335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
341 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.96 
 
 
326 aa  308  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.93 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  51.56 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  50.98 
 
 
336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.29 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.11 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 
346 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.46 
 
 
326 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.48 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  49.06 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.73 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.8 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.11 
 
 
322 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 
326 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.06 
 
 
323 aa  299  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.28 
 
 
325 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.02 
 
 
339 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  42.72 
 
 
325 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.55 
 
 
327 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.48 
 
 
343 aa  299  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.39 
 
 
339 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.31 
 
 
322 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.96 
 
 
324 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.87 
 
 
347 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.26 
 
 
326 aa  298  1e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.44 
 
 
325 aa  297  1e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  47.38 
 
 
336 aa  296  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0509  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.3 
 
 
326 aa  296  4e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.27 
 
 
325 aa  295  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>