More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3298 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
330 aa  672    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
330 aa  672    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.89 
 
 
325 aa  378  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.86 
 
 
324 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
324 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
321 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
321 aa  362  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.03 
 
 
325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.03 
 
 
325 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.35 
 
 
324 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 
325 aa  358  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.26 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.89 
 
 
325 aa  355  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
326 aa  355  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 
326 aa  355  7.999999999999999e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.48 
 
 
327 aa  354  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.41 
 
 
322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.52 
 
 
325 aa  352  4e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  59.08 
 
 
324 aa  352  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53 
 
 
329 aa  352  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 
326 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  351  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  350  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  350  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  349  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
329 aa  349  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.69 
 
 
324 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.26 
 
 
325 aa  349  3e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.4 
 
 
335 aa  348  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 
326 aa  348  7e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
352 aa  348  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  55.31 
 
 
328 aa  347  2e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  54.49 
 
 
325 aa  345  8e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.37 
 
 
323 aa  344  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.77 
 
 
324 aa  344  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
339 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 
326 aa  344  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.11 
 
 
325 aa  343  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.89 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 
325 aa  342  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 
337 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.17 
 
 
322 aa  341  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
339 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.63 
 
 
324 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.77 
 
 
324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.18 
 
 
327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.77 
 
 
324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
323 aa  339  4e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.66 
 
 
323 aa  339  4e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 
326 aa  339  4e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.83 
 
 
329 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 
327 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  50.31 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.64 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 
327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.48 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  53.44 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 
322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  55.88 
 
 
327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
325 aa  335  5e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 
327 aa  335  5e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  52.28 
 
 
338 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 
328 aa  334  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 
328 aa  334  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  53.46 
 
 
325 aa  334  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 
322 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  48.9 
 
 
325 aa  333  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 
322 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  53.09 
 
 
336 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.59 
 
 
322 aa  331  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
328 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.16 
 
 
326 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  51.99 
 
 
340 aa  329  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  52.58 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.02 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.56 
 
 
327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  53.37 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.06 
 
 
341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  52.94 
 
 
340 aa  325  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1362  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.66 
 
 
326 aa  325  6e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.414153  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  53.92 
 
 
340 aa  325  7e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.82 
 
 
343 aa  325  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0015  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.78 
 
 
326 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.767271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.17 
 
 
336 aa  324  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.17 
 
 
323 aa  324  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.45 
 
 
341 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
341 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
328 aa  323  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.24 
 
 
329 aa  322  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  49.69 
 
 
327 aa  322  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0794  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.86 
 
 
327 aa  322  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.535148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>