More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3254 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  100 
 
 
351 aa  698    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  67.92 
 
 
328 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.93 
 
 
324 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  64.12 
 
 
323 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  67.45 
 
 
324 aa  415  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.76 
 
 
327 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.52 
 
 
336 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  62.39 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.76 
 
 
323 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.31 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  64.53 
 
 
328 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.75 
 
 
328 aa  396  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.65 
 
 
327 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  64.56 
 
 
330 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  58.65 
 
 
340 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.68 
 
 
327 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  61.7 
 
 
330 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.7 
 
 
323 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.7 
 
 
323 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.23 
 
 
329 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.7 
 
 
323 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  60.12 
 
 
340 aa  383  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.65 
 
 
326 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  63.2 
 
 
329 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  60.35 
 
 
344 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.17 
 
 
327 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  60.12 
 
 
335 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.53 
 
 
329 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  63.19 
 
 
328 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.43 
 
 
326 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.02 
 
 
326 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.4 
 
 
338 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.7 
 
 
327 aa  361  9e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  60.62 
 
 
329 aa  351  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.25 
 
 
340 aa  348  7e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  56.85 
 
 
325 aa  345  7e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  59.88 
 
 
332 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.48 
 
 
352 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  52.33 
 
 
325 aa  324  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.65 
 
 
326 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.58 
 
 
326 aa  323  2e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.58 
 
 
324 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.84 
 
 
325 aa  322  6e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.28 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.66 
 
 
325 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.42 
 
 
324 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.01 
 
 
327 aa  319  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.54 
 
 
323 aa  318  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  50.71 
 
 
330 aa  318  7e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.14 
 
 
343 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.67 
 
 
321 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.38 
 
 
321 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.41 
 
 
347 aa  317  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.83 
 
 
325 aa  315  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.8 
 
 
324 aa  315  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.8 
 
 
322 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.8 
 
 
326 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.55 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.97 
 
 
324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.67 
 
 
315 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.35 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.46 
 
 
327 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.43 
 
 
341 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.43 
 
 
341 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.94 
 
 
336 aa  311  9e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  47.11 
 
 
336 aa  311  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.4 
 
 
322 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.14 
 
 
341 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.78 
 
 
329 aa  310  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.1 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.25 
 
 
327 aa  309  5e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.27 
 
 
326 aa  309  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  50.87 
 
 
325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  48.7 
 
 
328 aa  308  9e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
329 aa  308  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.8 
 
 
322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.08 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.66 
 
 
329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.31 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  50.75 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.31 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
329 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.51 
 
 
322 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
329 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
329 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
326 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
329 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
329 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.37 
 
 
329 aa  305  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.22 
 
 
322 aa  305  6e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  49.39 
 
 
336 aa  305  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.7 
 
 
330 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.7 
 
 
330 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.57 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.45 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.97 
 
 
326 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.96 
 
 
326 aa  301  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.99 
 
 
324 aa  301  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.72 
 
 
327 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>