More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4014 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
336 aa  652    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  72.76 
 
 
328 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.12 
 
 
327 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  73.62 
 
 
330 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.53 
 
 
324 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.4 
 
 
323 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  66.36 
 
 
340 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.5 
 
 
327 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.57 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  67.18 
 
 
340 aa  411  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  68.67 
 
 
330 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  68.22 
 
 
324 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  64.35 
 
 
323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.87 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.88 
 
 
328 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  63.93 
 
 
351 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.01 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  66.14 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.46 
 
 
326 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.9 
 
 
327 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  64.85 
 
 
335 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  64.87 
 
 
325 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64 
 
 
329 aa  394  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.95 
 
 
329 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.64 
 
 
323 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.64 
 
 
323 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.64 
 
 
323 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  66.46 
 
 
329 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  62.35 
 
 
344 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  62.31 
 
 
325 aa  368  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  63.99 
 
 
332 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.24 
 
 
338 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.44 
 
 
326 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.13 
 
 
326 aa  364  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  63.58 
 
 
328 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.01 
 
 
340 aa  355  5.999999999999999e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  62.46 
 
 
329 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.16 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.04 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.64 
 
 
352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 
322 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.96 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  54.09 
 
 
330 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.31 
 
 
326 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 
324 aa  309  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  51.57 
 
 
328 aa  309  5e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
326 aa  308  6.999999999999999e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.19 
 
 
322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.91 
 
 
335 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.63 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.04 
 
 
341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.78 
 
 
328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.78 
 
 
328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.74 
 
 
341 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.88 
 
 
322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  50.94 
 
 
330 aa  302  6.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
324 aa  302  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.08 
 
 
326 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.52 
 
 
346 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.52 
 
 
334 aa  300  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
325 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.71 
 
 
324 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.71 
 
 
324 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  50.16 
 
 
325 aa  299  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.04 
 
 
341 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.5 
 
 
325 aa  298  7e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  55.88 
 
 
327 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.39 
 
 
324 aa  296  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.63 
 
 
324 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.73 
 
 
325 aa  296  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.46 
 
 
327 aa  297  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.11 
 
 
324 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0171  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.26 
 
 
324 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
326 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.47 
 
 
317 aa  296  2e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.69 
 
 
322 aa  296  3e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  51.8 
 
 
336 aa  295  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.96 
 
 
326 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.65 
 
 
325 aa  295  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.2 
 
 
326 aa  295  7e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
327 aa  295  8e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.16 
 
 
326 aa  295  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.45 
 
 
322 aa  293  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0015  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
326 aa  293  4e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.767271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
329 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  46.88 
 
 
327 aa  292  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.78 
 
 
315 aa  292  6e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  46.6 
 
 
336 aa  292  7e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.88 
 
 
323 aa  292  7e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 
325 aa  292  7e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2986  Porphobilinogen synthase  49.85 
 
 
348 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199631  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.02 
 
 
325 aa  291  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.25 
 
 
323 aa  291  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.65 
 
 
325 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.22 
 
 
329 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>