More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6727 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 324 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.02 
 
 		 323 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  72.59 
 
 		 323 aa  474  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  71.47 
 
 		 340 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.6 
 
 		 327 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.14 
 
 		 327 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  70.09 
 
 		 335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.57 
 
 		 329 aa  448  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  69.44 
 
 		 325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.53 
 
 		 336 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.83 
 
 		 327 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  69.69 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.7 
 
 		 327 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.85 
 
 		 327 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.14 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  69.54 
 
 		 330 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.4 
 
 		 326 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70 
 
 		 328 aa  428  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  67.18 
 
 		 328 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  69.68 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.49 
 
 		 329 aa  421  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  69.88 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.44 
 
 		 323 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.44 
 
 		 323 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.44 
 
 		 323 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  65.63 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  63.05 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  64.63 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.56 
 
 		 338 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  66.56 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  67.39 
 
 		 329 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  65.94 
 
 		 328 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.73 
 
 		 340 aa  384  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  66.45 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  62.85 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.05 
 
 		 352 aa  360  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.73 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.45 
 
 		 326 aa  346  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 		 322 aa  338  7e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  54.97 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.84 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.44 
 
 		 322 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.13 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.54 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.24 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.12 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  52.17 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 		 324 aa  331  9e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  52.17 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.68 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.07 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.74 
 
 		 321 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 		 323 aa  325  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 		 326 aa  325  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.92 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.74 
 
 		 321 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  51.84 
 
 		 325 aa  324  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.45 
 
 		 328 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.45 
 
 		 328 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.45 
 
 		 329 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  46.48 
 
 		 336 aa  322  7e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 		 326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.4 
 
 		 336 aa  319  5e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.9 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  52.42 
 
 		 340 aa  316  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 329 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 329 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 		 329 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.83 
 
 		 324 aa  315  9e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.28 
 
 		 329 aa  315  9e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.11 
 
 		 324 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.9 
 
 		 329 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  52.5 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.08 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.47 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 		 329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  51.15 
 
 		 336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.14 
 
 		 336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.58 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.14 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.14 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>