More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1236 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1236  inner-membrane translocator  100 
 
 		 280 aa  535  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  28.93 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  32.86 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1178  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1353  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2271  inner-membrane translocator  33.58 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.921298  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  30.6 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.34 
 
 		 289 aa  99.4  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  33.59 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 289 aa  98.6  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1364  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3243  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.577561  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0058  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  29.67 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4451  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0584854  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8052  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  31 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4909  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  30.08 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  30.43 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  28.68 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  29.47 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  31.39 
 
 		 295 aa  92  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.68 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3519  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  28.68 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  28.68 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  27.17 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  27.94 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 320 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 320 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  28.31 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 652 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  28.86 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  30.26 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  27.57 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  30.74 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4218  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  29.35 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  30.51 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  30.18 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3321  inner-membrane translocator  31.56 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  27.92 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4108  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 283 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0956  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3536  inner-membrane translocator  27.47 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0293486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.21 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0897  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.22 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  27.56 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3184  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.819999 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  28.52 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3866  inner-membrane translocator  28.22 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8565  inner-membrane translocator  31.29 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0330607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3341  transmembrane ABC transporter protein  28.32 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3476  inner-membrane translocator  29.29 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  26.47 
 
 		 294 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  31 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  29.24 
 
 		 628 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  29.74 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  27.11 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  29.45 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5445  ABC transporter membrane spanning protein  30.04 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0977  urea ABC transporter, permease protein UrtB  26.99 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4296  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  26.74 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  27.08 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  31.14 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3757  putative branched-chain amino acid transport permease  26.37 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3967  ABC branched chain amino acid transporter, inner membrane subunit  27.94 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3380  urea ABC transporter, permease protein UrtB  28.18 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>