75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0621 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0621  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  280  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.503342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  36.46 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  30.85 
 
 		 300 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  27.42 
 
 		 323 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  37.66 
 
 		 357 aa  50.8  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  39.34 
 
 		 375 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  31.31 
 
 		 347 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  39.34 
 
 		 376 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  39.34 
 
 		 380 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  31.31 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  37.21 
 
 		 321 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 325 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  31.25 
 
 		 336 aa  48.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 326 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  32.43 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  39.39 
 
 		 324 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  38.03 
 
 		 364 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  29.27 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  29.27 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  33.93 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  31.19 
 
 		 314 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  36.9 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  36.9 
 
 		 337 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  30.26 
 
 		 340 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  36.9 
 
 		 336 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  36.9 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  36.9 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  36.9 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  36.9 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  36.9 
 
 		 337 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 337 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 307 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  28.7 
 
 		 293 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  30.58 
 
 		 281 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  31.25 
 
 		 374 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  31.94 
 
 		 321 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  37.7 
 
 		 311 aa  43.9  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  31.4 
 
 		 271 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  31.03 
 
 		 336 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  32.04 
 
 		 360 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  31.52 
 
 		 325 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  38.1 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  31.07 
 
 		 387 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  38.1 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  38.1 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  38.1 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  38.1 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  31.07 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  29.55 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 342 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  31.07 
 
 		 387 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1997  hypothetical protein  26.6 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 345 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  25 
 
 		 372 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  30.49 
 
 		 367 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  31.07 
 
 		 387 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  30.77 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  34.72 
 
 		 336 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  27.16 
 
 		 340 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  34.72 
 
 		 336 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  29.75 
 
 		 273 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  25.86 
 
 		 312 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  29.49 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  35.09 
 
 		 331 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  34.52 
 
 		 323 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 314 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  30.26 
 
 		 311 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  30.86 
 
 		 350 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  35 
 
 		 286 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  35 
 
 		 286 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 328 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>