116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0368 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0350  peptidase M23B  99.45 
 
 
546 aa  1089    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961485  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0368  peptidase M23  100 
 
 
554 aa  1110    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  31.85 
 
 
526 aa  248  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1557  peptidoglycan-binding LysM  29.18 
 
 
517 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  28.78 
 
 
597 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  31.22 
 
 
284 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  30.46 
 
 
430 aa  66.6  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  37 
 
 
352 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2880  3D domain protein  39.24 
 
 
236 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3534  3D domain-containing protein  40.79 
 
 
219 aa  62  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0180  hypothetical protein  39.47 
 
 
208 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5061  hypothetical protein  40.79 
 
 
208 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3025  3D domain protein  37.97 
 
 
212 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4744  3D domain-containing protein  40.79 
 
 
219 aa  60.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  35.96 
 
 
249 aa  60.1  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4634  hypothetical protein  39.47 
 
 
219 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5156  hypothetical protein  39.47 
 
 
208 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5067  hypothetical protein  39.47 
 
 
208 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  31.02 
 
 
602 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4793  hypothetical protein  39.47 
 
 
219 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4654  hypothetical protein  39.47 
 
 
219 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  31.63 
 
 
297 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5062  3D domain protein  39.47 
 
 
206 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5033  hypothetical protein  39.47 
 
 
219 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  31.58 
 
 
375 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  29.36 
 
 
509 aa  57.4  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  43.42 
 
 
231 aa  57  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  38.46 
 
 
269 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  30.77 
 
 
414 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  25.7 
 
 
455 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2504  hypothetical protein  35.42 
 
 
429 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  31.77 
 
 
240 aa  53.5  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0310  hypothetical protein  37.14 
 
 
348 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  23.1 
 
 
404 aa  53.5  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  34.82 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1049  3D domain protein  37.66 
 
 
145 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  26.98 
 
 
320 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  35.14 
 
 
457 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  35.14 
 
 
457 aa  50.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  28.26 
 
 
375 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  26 
 
 
314 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  32.06 
 
 
346 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.89 
 
 
1021 aa  50.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  26.84 
 
 
417 aa  50.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  29.14 
 
 
482 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3275  3D domain protein  36.36 
 
 
284 aa  49.7  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  24.19 
 
 
1189 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  30.93 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3146  peptidase M23B  31.2 
 
 
246 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  30.32 
 
 
448 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  30.09 
 
 
417 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  26.63 
 
 
325 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  16.37 
 
 
2228 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  31.25 
 
 
314 aa  48.9  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  35.64 
 
 
457 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  28.68 
 
 
377 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  26.69 
 
 
408 aa  47.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4456  peptidase M23B  25 
 
 
244 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3910  peptidase M23B  25 
 
 
244 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  33.04 
 
 
332 aa  47.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3617  peptidase M23B  25 
 
 
244 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  35.16 
 
 
356 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  29.01 
 
 
323 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  30.53 
 
 
354 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  33.33 
 
 
317 aa  47.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  29.46 
 
 
230 aa  47.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  26.81 
 
 
392 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  31.67 
 
 
465 aa  47  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  36.04 
 
 
420 aa  47  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  29.01 
 
 
407 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  29.03 
 
 
379 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  27.5 
 
 
230 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  29.06 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  29.03 
 
 
276 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0573  3D domain protein  39.66 
 
 
260 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  27.34 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  32.17 
 
 
186 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  29.84 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  24.46 
 
 
431 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  28.57 
 
 
460 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  30.37 
 
 
367 aa  46.2  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  29.9 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  32.58 
 
 
669 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  29.13 
 
 
464 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  25.77 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  32.17 
 
 
186 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  27.34 
 
 
439 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  31.03 
 
 
285 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  30.89 
 
 
429 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  31.71 
 
 
372 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  28.68 
 
 
394 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  26.11 
 
 
468 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  38.24 
 
 
285 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  28.37 
 
 
321 aa  45.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  31.09 
 
 
377 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  38.98 
 
 
410 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  25.34 
 
 
314 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  34.91 
 
 
301 aa  45.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  25.12 
 
 
238 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  29.1 
 
 
316 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>