134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2504 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2504  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  874    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0310  hypothetical protein  70.83 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  48.74 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  47.9 
 
 		 342 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  46.61 
 
 		 343 aa  89.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  41.88 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1049  3D domain protein  42.86 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3025  3D domain protein  39.82 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4744  3D domain-containing protein  39.66 
 
 		 219 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2880  3D domain protein  38.6 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5061  hypothetical protein  39.29 
 
 		 208 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3534  3D domain-containing protein  41.57 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4793  hypothetical protein  43.53 
 
 		 219 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4634  hypothetical protein  43.53 
 
 		 219 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4654  hypothetical protein  43.53 
 
 		 219 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5156  hypothetical protein  43.53 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5033  hypothetical protein  43.53 
 
 		 219 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  38.46 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5067  hypothetical protein  43.53 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  50 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5062  3D domain protein  43.53 
 
 		 206 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  35.59 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0180  hypothetical protein  42.35 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  37.4 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  47.37 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  47.37 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  44.57 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1557  peptidoglycan-binding LysM  44.93 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  41.76 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  42.16 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  37.69 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0069  3D domain protein  36.92 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1114  3D domain protein  41.25 
 
 		 1063 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  37.69 
 
 		 524 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  36.64 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2273  enterotoxin  36.92 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0333544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2968  enterotoxin  36.92 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  37.72 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  44.74 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  43.42 
 
 		 575 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  44.74 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  44.74 
 
 		 570 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  36.64 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  36.92 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  36.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  36.92 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  36.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  40 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  36.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4920  enterotoxin/cell wall-binding protein  36.43 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  36.43 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  36.43 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  36.43 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  40.23 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  36.43 
 
 		 290 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  36.07 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  35.62 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  41.76 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  36.07 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0757  hypothetical protein  36.07 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0706  enterotoxin/cell wall-binding protein  36.07 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  36.07 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0796  hypothetical protein  36.07 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  34.93 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40.54 
 
 		 204 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  35 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0350  peptidase M23B  40.85 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  35.66 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  36.07 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0891  enterotoxin  36.07 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46371e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0959  enterotoxin  36.07 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0599  3D domain-containing protein  37.19 
 
 		 431 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  36.67 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0368  peptidase M23  35.42 
 
 		 554 aa  53.9  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0573  3D domain protein  51.79 
 
 		 260 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  36.67 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  40.79 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  40.79 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  40.79 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0651  hypothetical protein  43.42 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0595  hypothetical protein  43.42 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  40.79 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  40.79 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  40.79 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0685  hypothetical protein  43.42 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00231685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  40.45 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0574  3D domain-containing protein  35.09 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  40.79 
 
 		 297 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3481  3D domain-containing protein  45.16 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00402969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  40.79 
 
 		 310 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0438  3D domain-containing protein  36.52 
 
 		 249 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0752  hypothetical protein  42.86 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  39.47 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0596  hypothetical protein  35.96 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4620  hypothetical protein  35.54 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944224 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  39.47 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0740  hypothetical protein  42.86 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000128558 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  47.46 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  41.54 
 
 		 597 aa  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0716  hypothetical protein  42.86 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.663265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>