150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1285 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1285  MltA  100 
 
 
386 aa  791    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  44.38 
 
 
418 aa  313  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  43.8 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  45.4 
 
 
356 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  44.67 
 
 
405 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.94 
 
 
400 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  37.09 
 
 
421 aa  266  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  37.36 
 
 
402 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.55 
 
 
386 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  37.36 
 
 
399 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.53 
 
 
385 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  37.36 
 
 
403 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  37.27 
 
 
410 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  36.9 
 
 
383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  37.7 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  37.17 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  36.97 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  37.17 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  38.28 
 
 
386 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  36.69 
 
 
392 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  36.84 
 
 
398 aa  242  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  37.43 
 
 
409 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  36.57 
 
 
396 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  35.64 
 
 
410 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  35.11 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  36.13 
 
 
383 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.68 
 
 
374 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.66 
 
 
410 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.48 
 
 
425 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.48 
 
 
425 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.48 
 
 
425 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.48 
 
 
425 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.48 
 
 
372 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.48 
 
 
382 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  38.48 
 
 
433 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  37.7 
 
 
410 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.26 
 
 
404 aa  232  8.000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  34.41 
 
 
374 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  36.09 
 
 
393 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  34.34 
 
 
475 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 
543 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  33.25 
 
 
382 aa  219  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  33.89 
 
 
500 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  36.45 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  35.53 
 
 
352 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 
502 aa  210  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.56 
 
 
342 aa  209  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  32.16 
 
 
380 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  31.87 
 
 
384 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  32.54 
 
 
380 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  35.89 
 
 
497 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  38.25 
 
 
341 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  33.24 
 
 
542 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  31.47 
 
 
375 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  33.74 
 
 
412 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.71 
 
 
506 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  33.53 
 
 
376 aa  199  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  35.34 
 
 
492 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  29.82 
 
 
456 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  29.19 
 
 
433 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  30.7 
 
 
380 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  30.7 
 
 
402 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  32.87 
 
 
368 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  35.42 
 
 
440 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  29.58 
 
 
435 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  30.71 
 
 
398 aa  189  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  33.72 
 
 
405 aa  189  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  35.63 
 
 
341 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  35.63 
 
 
341 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  27.84 
 
 
431 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  29.14 
 
 
416 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  36.26 
 
 
416 aa  185  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  39.03 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  39.03 
 
 
395 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.92 
 
 
399 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  31.97 
 
 
396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  29.63 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0520  3D domain protein  28.81 
 
 
534 aa  180  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  31.62 
 
 
514 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  32 
 
 
354 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  29.05 
 
 
397 aa  176  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  32.78 
 
 
382 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  28.77 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  39.93 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  31.83 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  28.85 
 
 
400 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  31.55 
 
 
369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  31.54 
 
 
413 aa  166  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  36.56 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  37.55 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  37.22 
 
 
412 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  25.61 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  32.34 
 
 
407 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  31.54 
 
 
372 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  31.16 
 
 
372 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  34.85 
 
 
401 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  31.96 
 
 
398 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  31.65 
 
 
365 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  30.03 
 
 
383 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  31.16 
 
 
387 aa  149  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>