60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1716 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 597 aa  1191    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  32.2 
 
 		 526 aa  207  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0368  peptidase M23  28.78 
 
 		 554 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0350  peptidase M23B  29.01 
 
 		 546 aa  204  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961485  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1557  peptidoglycan-binding LysM  30.58 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 382 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3275  3D domain protein  32.91 
 
 		 284 aa  55.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  39.76 
 
 		 356 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  36.62 
 
 		 337 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4744  3D domain-containing protein  39.33 
 
 		 219 aa  53.9  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  36.62 
 
 		 337 aa  53.9  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4654  hypothetical protein  38.2 
 
 		 219 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4793  hypothetical protein  38.2 
 
 		 219 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5061  hypothetical protein  39.33 
 
 		 208 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0310  hypothetical protein  41.18 
 
 		 348 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5067  hypothetical protein  38.2 
 
 		 208 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5062  3D domain protein  38.2 
 
 		 206 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  34.78 
 
 		 352 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5033  hypothetical protein  38.2 
 
 		 219 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5156  hypothetical protein  38.2 
 
 		 208 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4634  hypothetical protein  38.2 
 
 		 219 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0180  hypothetical protein  38.2 
 
 		 208 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  37.5 
 
 		 329 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3534  3D domain-containing protein  39.36 
 
 		 219 aa  50.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  47.17 
 
 		 410 aa  50.4  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  47.17 
 
 		 410 aa  50.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2504  hypothetical protein  41.54 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  33.72 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2880  3D domain protein  37.65 
 
 		 236 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  37.04 
 
 		 548 aa  48.9  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  27.19 
 
 		 374 aa  47.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  52 
 
 		 183 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  33.82 
 
 		 320 aa  47.8  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  27.68 
 
 		 733 aa  47.4  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  23.26 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  34.21 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  25.91 
 
 		 314 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  44.07 
 
 		 277 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  25.85 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  44.07 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0438  3D domain-containing protein  50 
 
 		 249 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1409  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 159 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000791474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  40.32 
 
 		 343 aa  45.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  44.23 
 
 		 389 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  40.58 
 
 		 203 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3025  3D domain protein  35.29 
 
 		 212 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  45.83 
 
 		 552 aa  44.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3803  lysM domain protein  39.22 
 
 		 159 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  hitchhiker  1.81276e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  37.5 
 
 		 275 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1542  lysM domain protein  39.22 
 
 		 159 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  26.32 
 
 		 434 aa  44.3  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1210  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 160 aa  44.3  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000146268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.74 
 
 		 532 aa  44.3  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  33.33 
 
 		 340 aa  44.3  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  44.3  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  33.33 
 
 		 340 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  26.6 
 
 		 242 aa  43.9  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  36.51 
 
 		 342 aa  43.9  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  32.38 
 
 		 515 aa  43.5  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  19.81 
 
 		 1153 aa  43.5  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>