264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03530 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  100 
 
 
407 aa  823    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  44.12 
 
 
417 aa  341  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  43.42 
 
 
422 aa  313  4.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  31.73 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  29.14 
 
 
419 aa  184  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  31.31 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  31.47 
 
 
418 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  27.88 
 
 
446 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  27.72 
 
 
475 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  25.65 
 
 
394 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  25.17 
 
 
431 aa  134  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  38.78 
 
 
490 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  26.68 
 
 
400 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  26.89 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  32.17 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  39.01 
 
 
503 aa  98.6  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  26.19 
 
 
495 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.59 
 
 
394 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  24.58 
 
 
397 aa  93.2  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  22.79 
 
 
465 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  33.73 
 
 
516 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  23.08 
 
 
404 aa  89.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.55 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  20.64 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  31.62 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  20.98 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  28.29 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.71 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  22.28 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  22.82 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  28.74 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  28.17 
 
 
438 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  28.17 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  28.17 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  31.58 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  33.07 
 
 
420 aa  76.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  23.61 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  21.62 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  32.59 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  21.84 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  31.43 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  31.43 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  31.88 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.15 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  22.38 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  23.38 
 
 
456 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  31.85 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  21.73 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  33.09 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.17 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  28.77 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  27.65 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  28.87 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  23.13 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  23.13 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  21.7 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  27.91 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  21.53 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  22.56 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  31.11 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  23.13 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  22.91 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  22.94 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  24.3 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  28.9 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  23.61 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  28.9 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  22.47 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  26.42 
 
 
375 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  27.83 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  19.66 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  30.37 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  22.59 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  32.09 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  28.03 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  24.76 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  26.67 
 
 
420 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  29.94 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  21.46 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  22.62 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  22.38 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  22.62 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  27.59 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  30.22 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  22.38 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  22.62 
 
 
427 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  29.32 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  21.96 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  21.96 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  21.96 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  31.78 
 
 
301 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  29.46 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  22.01 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  25.93 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  21.01 
 
 
427 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  22.8 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  26.9 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  24.11 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  20.87 
 
 
427 aa  63.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>