More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2671 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2671  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 363 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  27.57 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05175  alpha/beta hydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07060)  35.2 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0627526  normal  0.0627844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1744  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0831035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.39 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.39 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.04 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.23 
 
 		 369 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  40.37 
 
 		 2762 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.04 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.35 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.62 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.26 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  31.5 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06950  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 461 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  37.7 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.15 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.19 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  28.05 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.97 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  25 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  26.69 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  29.82 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  31.5 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  32.4 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.42 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  19.47 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 271 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 323 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>