247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1509 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 442 aa  886    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  51.06 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  47.14 
 
 		 525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  42.86 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  45.5 
 
 		 512 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  45.5 
 
 		 486 aa  326  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  43.82 
 
 		 503 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  47.62 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  44.54 
 
 		 531 aa  319  7e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  43.77 
 
 		 448 aa  316  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  44.18 
 
 		 554 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  39.6 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  38.24 
 
 		 443 aa  302  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  42.36 
 
 		 434 aa  296  6e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  44.88 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  40.27 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  45.35 
 
 		 443 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  41.85 
 
 		 462 aa  289  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  42.17 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  44.74 
 
 		 479 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  44.67 
 
 		 493 aa  286  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  43.99 
 
 		 545 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  45.48 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  46.77 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  37.17 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  43.22 
 
 		 474 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  46.51 
 
 		 364 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  49.66 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  41.58 
 
 		 523 aa  270  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  38.38 
 
 		 494 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  45.37 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  32.54 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  46.79 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  41.56 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  43 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  44.61 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  41.26 
 
 		 387 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  48.95 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  39.85 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  36.97 
 
 		 504 aa  239  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  37.83 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  35.86 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  38.39 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  39.22 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  37.85 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  39.19 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  37.84 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  31.3 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30.48 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  39.18 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  30.39 
 
 		 531 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  32.46 
 
 		 548 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  28.79 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  27.62 
 
 		 470 aa  170  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  31.77 
 
 		 495 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  32.54 
 
 		 495 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  32.3 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  31.53 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  32.31 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  29.14 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  28.68 
 
 		 500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 630 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  27.51 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  31.49 
 
 		 640 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  28.17 
 
 		 498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  28.09 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  31.08 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  32.36 
 
 		 504 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  30.58 
 
 		 420 aa  161  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  30.81 
 
 		 492 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  30.54 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  32.73 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  27.27 
 
 		 518 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  28.05 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  30.69 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  27.42 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  27.11 
 
 		 519 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  27.11 
 
 		 519 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  27.11 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  27.11 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  29.31 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  26.7 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  30.39 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  26.94 
 
 		 518 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  28.57 
 
 		 521 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  29.41 
 
 		 537 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  28.49 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  24.2 
 
 		 626 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  28.21 
 
 		 521 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  28.53 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  26.52 
 
 		 480 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  28.48 
 
 		 515 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  25.85 
 
 		 407 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  28.71 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  28.01 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  29.43 
 
 		 527 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  27.55 
 
 		 475 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  28.54 
 
 		 462 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  27.55 
 
 		 475 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  27.55 
 
 		 475 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>