204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1010 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 387 aa  756    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  50.16 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  52.05 
 
 		 479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  49.7 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  52.45 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  49.84 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  52.56 
 
 		 398 aa  298  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  46.88 
 
 		 525 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  53.95 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  51.37 
 
 		 501 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  49.35 
 
 		 523 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  48.46 
 
 		 364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  48.23 
 
 		 554 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  46.73 
 
 		 545 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  45.62 
 
 		 494 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  42.58 
 
 		 503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  44.38 
 
 		 512 aa  269  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  44.38 
 
 		 486 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  47.28 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  48.91 
 
 		 474 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  48.87 
 
 		 428 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  47.47 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  48.53 
 
 		 399 aa  263  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  41.72 
 
 		 459 aa  262  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  43.59 
 
 		 531 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  41.85 
 
 		 456 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  42.95 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  45.71 
 
 		 374 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  41.26 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  40.63 
 
 		 417 aa  252  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  47 
 
 		 493 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  43.05 
 
 		 462 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  44.76 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  36.57 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  38.36 
 
 		 417 aa  243  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  48.4 
 
 		 361 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  43.11 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  39.8 
 
 		 402 aa  229  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  36.39 
 
 		 473 aa  229  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  40.83 
 
 		 446 aa  219  5e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  41.2 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  39.79 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  39.72 
 
 		 428 aa  215  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  41.12 
 
 		 451 aa  215  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  37.42 
 
 		 504 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  39.1 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  40.82 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  28.34 
 
 		 532 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  38.98 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  30.74 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  32.4 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  31.46 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  29.81 
 
 		 530 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  30.29 
 
 		 420 aa  145  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  27.15 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  28.15 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  26.56 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  29.26 
 
 		 457 aa  139  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  31.76 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  28.62 
 
 		 630 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  29.28 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  29.28 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  29.28 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  29.28 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  29.28 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  29.28 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  29.28 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  29.28 
 
 		 475 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  29.28 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  29.94 
 
 		 485 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  28.95 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  28.95 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  28.95 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  28.95 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  28.95 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  31.42 
 
 		 491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  31.64 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  26.05 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  25.88 
 
 		 480 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  31.06 
 
 		 640 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  34.24 
 
 		 500 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  27.87 
 
 		 518 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  27.02 
 
 		 548 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  30.53 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  26.23 
 
 		 507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  31.42 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  31.03 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  30.53 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  31.68 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  32.33 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  30.65 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  32.93 
 
 		 504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  30.53 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  25.75 
 
 		 515 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  26.04 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  28.25 
 
 		 520 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  27.92 
 
 		 403 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  26.1 
 
 		 498 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  25.84 
 
 		 626 aa  123  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  26.2 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>