211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0971 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  100 
 
 
479 aa  924    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  61.68 
 
 
434 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  56.03 
 
 
494 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  52.18 
 
 
523 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  51.3 
 
 
525 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  51.21 
 
 
448 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  52.09 
 
 
474 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  49.11 
 
 
503 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  51.47 
 
 
386 aa  349  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  51.7 
 
 
501 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  51.93 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  48.24 
 
 
486 aa  338  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  47.03 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  54.21 
 
 
493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  55.03 
 
 
378 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  45.32 
 
 
456 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  49.27 
 
 
403 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  50.45 
 
 
443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  48.52 
 
 
462 aa  319  7e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  47.04 
 
 
554 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  43.47 
 
 
459 aa  316  7e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  52.05 
 
 
387 aa  315  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  49.45 
 
 
428 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  43.38 
 
 
531 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  54.73 
 
 
398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  40.64 
 
 
417 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  49.54 
 
 
364 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  54.77 
 
 
374 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  40.21 
 
 
402 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  47.21 
 
 
366 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  44.74 
 
 
442 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  39.88 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  40.51 
 
 
545 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  36.26 
 
 
443 aa  271  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  41.34 
 
 
445 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  50 
 
 
391 aa  263  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  37.04 
 
 
473 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  48.05 
 
 
390 aa  257  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  38.4 
 
 
504 aa  256  7e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  48.93 
 
 
399 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  50.87 
 
 
361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  41.1 
 
 
451 aa  252  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  39.95 
 
 
431 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  42.7 
 
 
428 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  45.62 
 
 
419 aa  239  6.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  40.26 
 
 
467 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  40.79 
 
 
403 aa  234  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  41.08 
 
 
446 aa  231  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30.73 
 
 
532 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  31.38 
 
 
531 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  31.23 
 
 
425 aa  203  5e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  32.33 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  27.58 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  26.86 
 
 
630 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  28.88 
 
 
498 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  33.64 
 
 
518 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  28.85 
 
 
515 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  28.69 
 
 
548 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  32 
 
 
520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  29.6 
 
 
424 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  25.71 
 
 
427 aa  155  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  30.51 
 
 
640 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  26.22 
 
 
535 aa  152  8.999999999999999e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  30.64 
 
 
475 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  30.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  30.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  30.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  30.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  30.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  30.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  30.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  30.64 
 
 
475 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  28.84 
 
 
420 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  27.52 
 
 
491 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  30.92 
 
 
476 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  30.92 
 
 
476 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  30.92 
 
 
476 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  30.92 
 
 
476 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  30.4 
 
 
485 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  30.92 
 
 
476 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  27.01 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  31.13 
 
 
500 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  25.37 
 
 
457 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  32.77 
 
 
510 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  31.46 
 
 
513 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  27.08 
 
 
522 aa  145  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  28.05 
 
 
453 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  29.37 
 
 
521 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  29.37 
 
 
521 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  29.37 
 
 
521 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  29 
 
 
518 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  26.74 
 
 
537 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  29 
 
 
519 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  29 
 
 
519 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  29 
 
 
519 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  29 
 
 
519 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  30.38 
 
 
515 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2422  hypothetical protein  26.25 
 
 
639 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  25 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  29.18 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>