196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2346 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  69.68 
 
 		 498 aa  701    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  72.83 
 
 		 537 aa  747    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  66 
 
 		 507 aa  674    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  75 
 
 		 519 aa  750    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1066    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  72.92 
 
 		 521 aa  747    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  73.21 
 
 		 521 aa  747    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  74.55 
 
 		 498 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  68.56 
 
 		 515 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  72.58 
 
 		 521 aa  747    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  75 
 
 		 519 aa  750    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  75 
 
 		 519 aa  750    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  67.7 
 
 		 491 aa  659    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  74.75 
 
 		 518 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  75 
 
 		 519 aa  750    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  73.4 
 
 		 518 aa  763    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  61.51 
 
 		 520 aa  634  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  60.12 
 
 		 506 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  60.46 
 
 		 518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  54.18 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  51.81 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  56.04 
 
 		 510 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  46.83 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  54.59 
 
 		 515 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  50.59 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  56 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  54.99 
 
 		 518 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  56.53 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  56.53 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  56.53 
 
 		 501 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  53.07 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  49.06 
 
 		 475 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  49.06 
 
 		 475 aa  415  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  55.65 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  49.06 
 
 		 475 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  55.65 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  49.06 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  48.82 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  48.82 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  55.65 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  55.65 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  49.06 
 
 		 475 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  52.36 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  55.65 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  49.06 
 
 		 475 aa  415  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  49.06 
 
 		 475 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  53.31 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  50.6 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  44.21 
 
 		 548 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  43.34 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  46.96 
 
 		 640 aa  362  8e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  44 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  41.14 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  45.28 
 
 		 424 aa  351  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  43.99 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  46.33 
 
 		 453 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  46.33 
 
 		 491 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  40.76 
 
 		 492 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  39.91 
 
 		 492 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  45.79 
 
 		 492 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  46.34 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  46.07 
 
 		 495 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  45.8 
 
 		 495 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  45.94 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  44.57 
 
 		 407 aa  331  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  46.69 
 
 		 491 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  47.06 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  43.15 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  40 
 
 		 494 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  44.65 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  40.45 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  39.16 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1481  protein of unknown function DUF195  39.07 
 
 		 435 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0981784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1370  protein of unknown function DUF195  39.07 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1053  hypothetical protein  38.21 
 
 		 437 aa  290  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2422  hypothetical protein  37.1 
 
 		 639 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  38.4 
 
 		 504 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0577  RmuC family protein  41.14 
 
 		 397 aa  280  6e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  35.63 
 
 		 535 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  37.35 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  42.62 
 
 		 530 aa  276  5e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0447  hypothetical protein  40.74 
 
 		 437 aa  274  3e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0432711  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  37.07 
 
 		 527 aa  273  5.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1094  hypothetical protein  37.36 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437038  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  34.87 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  37.31 
 
 		 612 aa  259  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  35.34 
 
 		 408 aa  254  3e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  32.88 
 
 		 630 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  37.27 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  36.98 
 
 		 626 aa  236  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  37.83 
 
 		 428 aa  225  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  32.75 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1026  RmuC family protein  34.22 
 
 		 435 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000225596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  31.37 
 
 		 451 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  29.24 
 
 		 503 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  26.42 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  28.98 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  29.04 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  26.89 
 
 		 531 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  28.81 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>