232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0691 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1055    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  69.49 
 
 
531 aa  718    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  34.32 
 
 
456 aa  237  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  32.38 
 
 
364 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  28.72 
 
 
531 aa  219  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  31.89 
 
 
545 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  31.19 
 
 
448 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  33.15 
 
 
417 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  30.7 
 
 
479 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  32.96 
 
 
428 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  30.48 
 
 
442 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  30.29 
 
 
523 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  30.6 
 
 
459 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  28.97 
 
 
462 aa  203  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  28.12 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  32.23 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  27.12 
 
 
504 aa  200  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  30.13 
 
 
378 aa  200  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  27.13 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  28.34 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  32.12 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  30.88 
 
 
525 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  30.7 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  33.11 
 
 
434 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  30 
 
 
501 aa  193  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  30.57 
 
 
554 aa  193  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  32.8 
 
 
403 aa  193  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  32.15 
 
 
434 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  28.07 
 
 
486 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  27.34 
 
 
473 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  28.52 
 
 
398 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  32.69 
 
 
374 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  30.37 
 
 
391 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  28.95 
 
 
493 aa  187  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  29.18 
 
 
417 aa  187  6e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  30.86 
 
 
445 aa  186  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  31.12 
 
 
494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  32.51 
 
 
399 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  33.69 
 
 
366 aa  183  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  30.07 
 
 
361 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  29.35 
 
 
443 aa  179  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  29.32 
 
 
390 aa  176  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  30 
 
 
492 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  30.27 
 
 
453 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  29.69 
 
 
492 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  28.93 
 
 
492 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  31.14 
 
 
402 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  29.67 
 
 
491 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  26.9 
 
 
495 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  29.24 
 
 
451 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  26.9 
 
 
495 aa  170  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  29.93 
 
 
467 aa  167  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  26.12 
 
 
495 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  25.92 
 
 
495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  31.11 
 
 
480 aa  164  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  32.08 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  30.26 
 
 
491 aa  162  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  29.86 
 
 
419 aa  160  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  30.43 
 
 
431 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  30.79 
 
 
407 aa  159  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  28.98 
 
 
527 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  27.01 
 
 
530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  31.68 
 
 
428 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  30.14 
 
 
506 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  25.29 
 
 
548 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  29.62 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  30.42 
 
 
498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  28.79 
 
 
518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  28.92 
 
 
500 aa  154  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  30.23 
 
 
494 aa  154  5e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  29.71 
 
 
491 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  28.61 
 
 
522 aa  153  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  29.01 
 
 
510 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  28.3 
 
 
515 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  28.89 
 
 
513 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  30.65 
 
 
507 aa  150  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  28.53 
 
 
510 aa  150  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  28.75 
 
 
535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  24.95 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  27.52 
 
 
520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  32.78 
 
 
403 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  29.02 
 
 
520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  27.76 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  27.76 
 
 
519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  29.45 
 
 
519 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  29.45 
 
 
519 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  27.79 
 
 
518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  29.45 
 
 
518 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  27.99 
 
 
425 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  28.76 
 
 
437 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  27.94 
 
 
494 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  29.13 
 
 
518 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  29.41 
 
 
504 aa  145  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  29.05 
 
 
626 aa  144  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  28.43 
 
 
521 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  28.99 
 
 
521 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  28.99 
 
 
521 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.04 
 
 
485 aa  144  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  28.99 
 
 
537 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  27.36 
 
 
476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>