246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  78.1 
 
 
495 aa  670    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  80.41 
 
 
492 aa  712    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  79.05 
 
 
492 aa  700    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  79.73 
 
 
492 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  77.25 
 
 
495 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  78.1 
 
 
495 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  77.43 
 
 
495 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  892    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  76.38 
 
 
491 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  94.68 
 
 
491 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  44.74 
 
 
513 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  46.77 
 
 
548 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  48.68 
 
 
510 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  48.89 
 
 
515 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  53.66 
 
 
437 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  47.88 
 
 
510 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  46.72 
 
 
498 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  50 
 
 
462 aa  358  9e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  46.17 
 
 
491 aa  356  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  47.44 
 
 
518 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  46.52 
 
 
537 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  48.47 
 
 
506 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  48.6 
 
 
424 aa  351  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  47.44 
 
 
518 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  47.44 
 
 
519 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  46.24 
 
 
521 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  47.44 
 
 
519 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  47.44 
 
 
519 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  47.44 
 
 
519 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  46.24 
 
 
521 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  46.24 
 
 
521 aa  349  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  46.33 
 
 
522 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  45.81 
 
 
498 aa  346  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  44.32 
 
 
518 aa  345  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  43.72 
 
 
507 aa  343  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  48.86 
 
 
420 aa  342  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  44.52 
 
 
475 aa  342  8e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  44.52 
 
 
475 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  45.38 
 
 
429 aa  342  8e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  44.25 
 
 
476 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  44.25 
 
 
476 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  44.25 
 
 
476 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  44.39 
 
 
520 aa  342  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  44.25 
 
 
476 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  44.29 
 
 
475 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  44.29 
 
 
475 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  44.29 
 
 
475 aa  342  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  44.29 
 
 
475 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  44.29 
 
 
475 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  44.25 
 
 
476 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  44.29 
 
 
475 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  44.29 
 
 
475 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  44.44 
 
 
485 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  42.3 
 
 
457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  50.72 
 
 
500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  45.74 
 
 
518 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  42.45 
 
 
520 aa  340  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  44.84 
 
 
427 aa  338  8e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  49.71 
 
 
640 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  43.81 
 
 
501 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  43.81 
 
 
501 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  43.81 
 
 
501 aa  335  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  47.41 
 
 
494 aa  333  3e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  44.9 
 
 
515 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  46 
 
 
448 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  44.56 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  43.66 
 
 
513 aa  326  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  43.4 
 
 
453 aa  326  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  45.22 
 
 
501 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  39.9 
 
 
470 aa  310  5e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  39.29 
 
 
407 aa  309  8e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0447  hypothetical protein  43.54 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0432711  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0577  RmuC family protein  40.37 
 
 
397 aa  301  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1053  hypothetical protein  40.67 
 
 
437 aa  296  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1481  protein of unknown function DUF195  37.47 
 
 
435 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0981784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  38.4 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1370  protein of unknown function DUF195  39.06 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  40.9 
 
 
626 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  37.95 
 
 
527 aa  283  6.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  35.29 
 
 
480 aa  276  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  43.33 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2422  hypothetical protein  38.25 
 
 
639 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  36.59 
 
 
612 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  38.82 
 
 
432 aa  268  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1094  hypothetical protein  39.53 
 
 
428 aa  268  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  35.75 
 
 
535 aa  266  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  36.21 
 
 
530 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  37.76 
 
 
510 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  38.55 
 
 
428 aa  256  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  33.12 
 
 
630 aa  255  9e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  35.8 
 
 
504 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1026  RmuC family protein  31.02 
 
 
435 aa  187  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000225596  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  34.96 
 
 
504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  32.92 
 
 
531 aa  177  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  28.72 
 
 
503 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  33.83 
 
 
445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  32.56 
 
 
494 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  32.12 
 
 
486 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30.03 
 
 
532 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  32.12 
 
 
512 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>