241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1093 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  100 
 
 
501 aa  981    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  61.98 
 
 
434 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  65.62 
 
 
443 aa  478  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  58.1 
 
 
474 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  55.38 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  54.9 
 
 
493 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  50.26 
 
 
525 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  53.8 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  48.91 
 
 
434 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  48.55 
 
 
503 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  43.83 
 
 
417 aa  343  5e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  48.94 
 
 
486 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  48.94 
 
 
512 aa  341  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  49.29 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  49.02 
 
 
366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  49.13 
 
 
386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  49.13 
 
 
554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  51.44 
 
 
428 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  47.61 
 
 
459 aa  334  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  45.81 
 
 
531 aa  332  1e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  48.63 
 
 
456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  47.35 
 
 
378 aa  325  2e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  43.38 
 
 
402 aa  323  3e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  48.72 
 
 
523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  46.23 
 
 
545 aa  315  9e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  52.04 
 
 
398 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  47.52 
 
 
403 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  45 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  39.73 
 
 
443 aa  307  3e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  43.92 
 
 
442 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  52.37 
 
 
364 aa  302  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  50 
 
 
374 aa  299  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  41.06 
 
 
473 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  39.57 
 
 
417 aa  294  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  50.66 
 
 
387 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  50 
 
 
391 aa  282  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  40.97 
 
 
445 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  44.85 
 
 
428 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  46.27 
 
 
399 aa  266  7e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  49.5 
 
 
361 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  41.87 
 
 
451 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  46.6 
 
 
390 aa  256  8e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  44.2 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  44.25 
 
 
446 aa  250  3e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  39.94 
 
 
467 aa  248  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  38.6 
 
 
504 aa  240  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  32.18 
 
 
425 aa  231  2e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  35.61 
 
 
431 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  43.79 
 
 
419 aa  229  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30 
 
 
532 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  31.88 
 
 
531 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  33.97 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  34.04 
 
 
492 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  27.92 
 
 
498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  34.29 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  34.45 
 
 
492 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  29.77 
 
 
453 aa  161  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  31.7 
 
 
476 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  31.7 
 
 
476 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  31.7 
 
 
476 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  31.7 
 
 
476 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  31.7 
 
 
476 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  33.65 
 
 
453 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  29.75 
 
 
515 aa  160  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  31.61 
 
 
485 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  32.25 
 
 
520 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  32.54 
 
 
518 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  32.7 
 
 
504 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  30.55 
 
 
475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  30.55 
 
 
475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  30.55 
 
 
475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  30.55 
 
 
475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  30.55 
 
 
475 aa  157  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  30.55 
 
 
475 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  30.55 
 
 
475 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  30.55 
 
 
475 aa  157  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  30.36 
 
 
500 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  33.44 
 
 
527 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  27.78 
 
 
518 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  28.84 
 
 
521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  28.84 
 
 
521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  28.84 
 
 
521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  29.08 
 
 
424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  30.26 
 
 
475 aa  154  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  33.84 
 
 
495 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  33.23 
 
 
495 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  27.25 
 
 
518 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  31.14 
 
 
640 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  27.25 
 
 
519 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  27.25 
 
 
519 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  27.8 
 
 
548 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  33.53 
 
 
495 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  27.51 
 
 
537 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  29.34 
 
 
518 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  26.98 
 
 
519 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  26.98 
 
 
519 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  33.23 
 
 
495 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  32.8 
 
 
491 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  30.03 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  28.31 
 
 
630 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>