242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3063 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  862    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  67.8 
 
 		 434 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  64.41 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  68.32 
 
 		 501 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  54.5 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  49.39 
 
 		 448 aa  360  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  48.76 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  46.32 
 
 		 503 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  46 
 
 		 525 aa  342  7e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  47.59 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  46.7 
 
 		 554 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  43.31 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  46.58 
 
 		 512 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  46.58 
 
 		 486 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  48.02 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  44.42 
 
 		 459 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  49.6 
 
 		 428 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  55.27 
 
 		 386 aa  325  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  50.45 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  46.03 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  49.08 
 
 		 378 aa  316  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  49.86 
 
 		 366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  39.85 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  44 
 
 		 545 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  43.78 
 
 		 462 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  41.41 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  53.92 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  44.35 
 
 		 523 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  43.73 
 
 		 442 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  39.35 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  51.1 
 
 		 398 aa  292  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  38.76 
 
 		 443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  49.68 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  47.47 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  51.53 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  39.85 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  48.85 
 
 		 361 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  44.89 
 
 		 391 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  42.52 
 
 		 451 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  44.07 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  37.27 
 
 		 504 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  42.86 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  43.28 
 
 		 390 aa  230  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  38.64 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  29.56 
 
 		 425 aa  222  9e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  40.38 
 
 		 428 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  36.04 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  37.7 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  40.3 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30.67 
 
 		 532 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  29.21 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  36.12 
 
 		 504 aa  156  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  27.12 
 
 		 510 aa  155  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  33.66 
 
 		 492 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  33.24 
 
 		 492 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  30.59 
 
 		 530 aa  151  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  26.12 
 
 		 518 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  27.57 
 
 		 498 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  27.42 
 
 		 515 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  27.3 
 
 		 424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  27.9 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  31.09 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  27.7 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  28.22 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  30.35 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  26.67 
 
 		 519 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  27.6 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  27.7 
 
 		 521 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  26.12 
 
 		 518 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  26.67 
 
 		 519 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  32.02 
 
 		 495 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  28.21 
 
 		 520 aa  146  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  27.22 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  30.34 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  26.39 
 
 		 519 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  26.39 
 
 		 519 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  29.62 
 
 		 453 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  25.63 
 
 		 491 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  25.22 
 
 		 626 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  29.47 
 
 		 513 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  26.1 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  25.43 
 
 		 470 aa  143  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.64 
 
 		 548 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  31.74 
 
 		 495 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.53 
 
 		 485 aa  143  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  28.22 
 
 		 630 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  28.84 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  32.36 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  28.77 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  28.77 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  28.77 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  28.77 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  28.77 
 
 		 476 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  32.04 
 
 		 495 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  28.02 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  28.82 
 
 		 501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  25.21 
 
 		 480 aa  140  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  27.21 
 
 		 475 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  27.21 
 
 		 475 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  27.21 
 
 		 475 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>