247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2859 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 512 aa  1028    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  100 
 
 		 486 aa  975    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  53.35 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  60.38 
 
 		 525 aa  489  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  51.53 
 
 		 531 aa  478  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  56.22 
 
 		 554 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  54.45 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  48.51 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  51.27 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  51.19 
 
 		 462 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  46.75 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  49.03 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  45.5 
 
 		 417 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  44.64 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  45.92 
 
 		 417 aa  343  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  49.72 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  48.47 
 
 		 479 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  53.46 
 
 		 364 aa  330  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  45.5 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  47.16 
 
 		 434 aa  326  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  45.53 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  48.07 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  48.38 
 
 		 378 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  46.59 
 
 		 434 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  45.91 
 
 		 493 aa  322  8e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  44.18 
 
 		 473 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  45.41 
 
 		 523 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  46.77 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  50.94 
 
 		 386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  38.36 
 
 		 545 aa  289  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  46.26 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  41.02 
 
 		 445 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  47.54 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  48.51 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  47.92 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  44.38 
 
 		 387 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  44.69 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  38.85 
 
 		 504 aa  266  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  42.94 
 
 		 451 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  42.76 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  39.9 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  43.81 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  43.05 
 
 		 446 aa  247  4e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  42.54 
 
 		 390 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  35.94 
 
 		 425 aa  238  3e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  39.62 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  38.84 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  40 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  40.12 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  29.72 
 
 		 531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  27.52 
 
 		 532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  27.88 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  32.28 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  28.7 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  35.07 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  32.12 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  28.43 
 
 		 530 aa  170  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  29.71 
 
 		 515 aa  169  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  31.16 
 
 		 640 aa  169  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  29.91 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  30.64 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  30.69 
 
 		 506 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  27.37 
 
 		 630 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  29.69 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  29.29 
 
 		 518 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  29.69 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  29.69 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  29.69 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  29.69 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  29.69 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  29.69 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  29.69 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  30.1 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  29.69 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  27.82 
 
 		 535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  29.77 
 
 		 501 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  34.67 
 
 		 495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  31.51 
 
 		 500 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  29.29 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  30.89 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  29.29 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  29.29 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  29.29 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  29.29 
 
 		 476 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  28.72 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  31.25 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  27.61 
 
 		 429 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  31.93 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  28.69 
 
 		 495 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  33.94 
 
 		 491 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  30.14 
 
 		 501 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  30.14 
 
 		 501 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  30.14 
 
 		 501 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  30.65 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  27.9 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  30.89 
 
 		 510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  30.58 
 
 		 513 aa  156  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  31.19 
 
 		 527 aa  156  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  29.31 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  28.33 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>