242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8478 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  863    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  70 
 
 
443 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  64.48 
 
 
474 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  67.03 
 
 
501 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  47.47 
 
 
434 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  52.29 
 
 
493 aa  362  9e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  49.48 
 
 
494 aa  360  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  47.74 
 
 
448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  50.99 
 
 
479 aa  349  6e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  45.87 
 
 
503 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  49.16 
 
 
525 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  50 
 
 
428 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  43.99 
 
 
459 aa  332  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  44.56 
 
 
512 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  46.11 
 
 
554 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  44.56 
 
 
486 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  41.55 
 
 
417 aa  328  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  50 
 
 
366 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  42.53 
 
 
402 aa  322  9.000000000000001e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  43.39 
 
 
523 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  44.53 
 
 
386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  47.42 
 
 
456 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  43.88 
 
 
531 aa  318  9e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  48.24 
 
 
378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  46.18 
 
 
545 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  43.02 
 
 
462 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  39.34 
 
 
443 aa  293  6e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  40.06 
 
 
473 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  49.24 
 
 
364 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  49.35 
 
 
398 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  39.68 
 
 
442 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  49.53 
 
 
403 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  37.5 
 
 
417 aa  282  9e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  49.43 
 
 
374 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  41.72 
 
 
387 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  38.31 
 
 
445 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  43.71 
 
 
391 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  39.41 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  44.04 
 
 
361 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  43.54 
 
 
399 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  40.71 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  40.92 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  41.13 
 
 
390 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  36.09 
 
 
504 aa  229  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  38.76 
 
 
451 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  39.09 
 
 
467 aa  224  3e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  35.99 
 
 
431 aa  223  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  39.77 
 
 
419 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  29.6 
 
 
425 aa  199  6e-50  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  29.84 
 
 
532 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  35.4 
 
 
531 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  33.22 
 
 
520 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  32.86 
 
 
518 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  28.76 
 
 
548 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  30.77 
 
 
492 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  32.56 
 
 
492 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  29.25 
 
 
453 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  32.99 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  27.67 
 
 
510 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  27.65 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  26.63 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  31.11 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  34.38 
 
 
504 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  30.09 
 
 
506 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  30.36 
 
 
495 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  30.06 
 
 
495 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.3 
 
 
485 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  30.42 
 
 
424 aa  143  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  29.76 
 
 
495 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  30.82 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  28.53 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  29.41 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  28.99 
 
 
640 aa  141  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  30.82 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  29.13 
 
 
453 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  29.72 
 
 
457 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  28.1 
 
 
507 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  26.86 
 
 
630 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  25.8 
 
 
522 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  26.86 
 
 
518 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  28.41 
 
 
476 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  28.41 
 
 
476 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  28.41 
 
 
476 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  26.86 
 
 
521 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  26.86 
 
 
521 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  26.86 
 
 
521 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  28.41 
 
 
476 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  25.43 
 
 
515 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  27.86 
 
 
475 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  28.41 
 
 
476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  27.86 
 
 
475 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  27.86 
 
 
475 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  28.66 
 
 
530 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  27.86 
 
 
475 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  26.54 
 
 
519 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  28.45 
 
 
518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  26.54 
 
 
519 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  27.86 
 
 
475 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  27.86 
 
 
475 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  26.54 
 
 
519 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>