244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1528 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  846    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  51.73 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  48.26 
 
 		 503 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  47.15 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  45.33 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  44.83 
 
 		 462 aa  354  1e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  45.5 
 
 		 512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  45.5 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  44.41 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  44.44 
 
 		 531 aa  347  2e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  46.05 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  44.64 
 
 		 448 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  46.63 
 
 		 554 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  43.67 
 
 		 474 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  43.84 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  42.61 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  39.85 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  44.85 
 
 		 501 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  44.35 
 
 		 443 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  39.3 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  45.79 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  37.9 
 
 		 473 aa  305  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  39.59 
 
 		 402 aa  302  8.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  41.64 
 
 		 493 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  40.34 
 
 		 386 aa  299  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  39.8 
 
 		 494 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  42.2 
 
 		 545 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  41.19 
 
 		 523 aa  293  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  42.44 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  41.88 
 
 		 479 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  43.11 
 
 		 378 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  43.39 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  39.44 
 
 		 504 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  44.41 
 
 		 374 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  39.14 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  40.63 
 
 		 387 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  43.99 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  40.73 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  36.88 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  39.26 
 
 		 451 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  44.17 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  41.23 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  41.67 
 
 		 361 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  38.27 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  39.93 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  36.9 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  38.34 
 
 		 419 aa  212  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  31.61 
 
 		 425 aa  209  5e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  33.15 
 
 		 532 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  39.25 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  29.81 
 
 		 531 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.3 
 
 		 548 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  28.5 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  28.61 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  27.22 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  29.24 
 
 		 612 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  25.27 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.61 
 
 		 485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  26.65 
 
 		 535 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 640 aa  156  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  28.73 
 
 		 407 aa  156  8e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  31.08 
 
 		 475 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  31.08 
 
 		 475 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  31.08 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  31.08 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  31.08 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  31.08 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  31.08 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  31.08 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  31.08 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  29.21 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  27.96 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  27.72 
 
 		 506 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  30.77 
 
 		 432 aa  152  8e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  28.98 
 
 		 476 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  30.53 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  27.27 
 
 		 518 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  30.98 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  30.36 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  26.74 
 
 		 518 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  27.44 
 
 		 521 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  27.44 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  27.52 
 
 		 530 aa  150  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  26.74 
 
 		 519 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  26.74 
 
 		 519 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  27.87 
 
 		 522 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  27.44 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  27.18 
 
 		 537 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  29.12 
 
 		 492 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  29.28 
 
 		 492 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  26.08 
 
 		 507 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  29.07 
 
 		 492 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  31.46 
 
 		 510 aa  149  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  26.51 
 
 		 498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  30.94 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  26.47 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  26.47 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  29.35 
 
 		 518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  30 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  25.83 
 
 		 518 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>