196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5568 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 473 aa  975    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  43.96 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  39.82 
 
 		 459 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  41.64 
 
 		 456 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  44.18 
 
 		 486 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  44.18 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  40.66 
 
 		 525 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  40.62 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  37.9 
 
 		 417 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  41.16 
 
 		 417 aa  302  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  42.9 
 
 		 448 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  39.3 
 
 		 531 aa  300  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  39.8 
 
 		 554 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  44.65 
 
 		 364 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  41.06 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  39.3 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  41.69 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  40.06 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  39.56 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  38.61 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  37.34 
 
 		 494 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  38.2 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  39.83 
 
 		 523 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  32.54 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  40 
 
 		 474 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  43.1 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  40.97 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  38.35 
 
 		 479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  37.5 
 
 		 434 aa  249  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  41.32 
 
 		 398 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  37.5 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  41.52 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  31.87 
 
 		 504 aa  230  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  31.58 
 
 		 545 aa  230  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  36.39 
 
 		 387 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  38.65 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  39.03 
 
 		 374 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  36.23 
 
 		 366 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  36.7 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  36.77 
 
 		 445 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  36.67 
 
 		 467 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  37.92 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  34.29 
 
 		 451 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  36.09 
 
 		 361 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  35.26 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  37.11 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  27.12 
 
 		 532 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  31.02 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  34.63 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.29 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  28.23 
 
 		 531 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  34.68 
 
 		 403 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  28.6 
 
 		 470 aa  179  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  27.77 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  27.77 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  27.77 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  27.77 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  27.77 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  27.77 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  27.77 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  27.77 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  27.77 
 
 		 475 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  30.69 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  29.95 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  29.95 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  29.95 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  29.95 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  29.95 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  29.56 
 
 		 518 aa  173  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  28.87 
 
 		 520 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  30.74 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  28.63 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  32.14 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  29.79 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  30.39 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  31.06 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  32.02 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  29.92 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  29.03 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  29.03 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  29.03 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  29.09 
 
 		 513 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  30.03 
 
 		 630 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  32.73 
 
 		 495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  27.63 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  28.95 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  29.38 
 
 		 453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  27.99 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  31.71 
 
 		 612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  31.25 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  28.17 
 
 		 506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  26.46 
 
 		 518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  27 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  28.16 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  28.24 
 
 		 515 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  31.58 
 
 		 492 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  28.54 
 
 		 530 aa  159  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  29.62 
 
 		 448 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  27.41 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  31.23 
 
 		 504 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>