245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2832 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  803    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  79.66 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  52.06 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  46.98 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  42.89 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  40.8 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  46.08 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  47.04 
 
 		 501 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  46.75 
 
 		 467 aa  272  8.000000000000001e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  40.11 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  42.79 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  40.56 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  42.69 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  41.5 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  42.58 
 
 		 493 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  41.08 
 
 		 479 aa  257  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  38.61 
 
 		 474 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  41.39 
 
 		 531 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  41.21 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  44.77 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  41.34 
 
 		 525 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  37.27 
 
 		 443 aa  248  1e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  34.34 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  38.27 
 
 		 523 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  40.36 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  39.07 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  40.29 
 
 		 391 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  39.63 
 
 		 459 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  40.12 
 
 		 512 aa  239  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  40.12 
 
 		 486 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  40.94 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  43.22 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  36.54 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  37.19 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  39.67 
 
 		 503 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  43.62 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  38.89 
 
 		 554 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  39.68 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  38.55 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  40.56 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  39.18 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  41.12 
 
 		 374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  34.7 
 
 		 425 aa  215  9e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  35.22 
 
 		 473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  35.83 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  36.77 
 
 		 451 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  35.01 
 
 		 504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  32.2 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  33.41 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  33.11 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  31.5 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  30.25 
 
 		 531 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  27.74 
 
 		 535 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  27.45 
 
 		 530 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  29.31 
 
 		 630 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  26.81 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  30.75 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  29.05 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  31.39 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  32.39 
 
 		 479 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  29.57 
 
 		 492 aa  136  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  31.63 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  28.21 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  29.7 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  28.21 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  31.11 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  30.38 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  28.21 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  28.21 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  28.21 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  27.9 
 
 		 518 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  33.45 
 
 		 495 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  32.59 
 
 		 495 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  32.22 
 
 		 495 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  27.11 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  30.71 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  29.62 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.41 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  31.85 
 
 		 495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  29.89 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  29.51 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  29.51 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  29.51 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  29.51 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  27.17 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  29.51 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  29 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  25.92 
 
 		 437 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  27.96 
 
 		 510 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  27.27 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  28.81 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0577  RmuC family protein  28.57 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  26.95 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  26.95 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  29.12 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  26.95 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0447  hypothetical protein  28.37 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0432711  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  29.45 
 
 		 548 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  31.72 
 
 		 640 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>