246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22950 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  775    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  51.59 
 
 		 378 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  46.63 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  45.32 
 
 		 448 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  48.88 
 
 		 386 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  47.17 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  48.53 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  46.8 
 
 		 523 aa  272  8.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  46.6 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  41.71 
 
 		 474 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  44.61 
 
 		 442 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  44.03 
 
 		 434 aa  266  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  47.77 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  46.35 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  44.82 
 
 		 531 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  48.15 
 
 		 364 aa  263  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  44.27 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  49.2 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  43.81 
 
 		 512 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  43.81 
 
 		 486 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  43.75 
 
 		 545 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  43.36 
 
 		 443 aa  259  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  40.17 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  47.51 
 
 		 374 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  44.69 
 
 		 493 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  43.33 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  40.63 
 
 		 503 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  46.05 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  40.98 
 
 		 459 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  40.84 
 
 		 494 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  45 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  40.73 
 
 		 554 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  45.98 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  41.32 
 
 		 445 aa  239  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  39.44 
 
 		 456 aa  239  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  43.4 
 
 		 467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  33.82 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  40.34 
 
 		 462 aa  230  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  45.39 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  38 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  33.65 
 
 		 443 aa  227  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  40.32 
 
 		 428 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  40.19 
 
 		 451 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  38.81 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  41.21 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  34.91 
 
 		 425 aa  208  1e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  36.19 
 
 		 431 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  37 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  34.13 
 
 		 473 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  31.46 
 
 		 532 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  30.19 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  32.71 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  32.71 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  34.21 
 
 		 640 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  31.55 
 
 		 492 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  27.08 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  32.94 
 
 		 491 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  31.23 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  32.05 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  28.48 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  32.64 
 
 		 495 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  31.05 
 
 		 500 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  30.7 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  29.78 
 
 		 520 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  31.75 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  31.45 
 
 		 495 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  31.56 
 
 		 548 aa  143  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  31.16 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  25.52 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  33.33 
 
 		 479 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  25.82 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  30.88 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  26.04 
 
 		 522 aa  136  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  27.38 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  27.05 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  27.39 
 
 		 491 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  31.62 
 
 		 530 aa  134  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  26.32 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  26.79 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  30.04 
 
 		 630 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  26.67 
 
 		 535 aa  133  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  24.25 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  31.87 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  26.71 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  26.53 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  27.88 
 
 		 507 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  31.21 
 
 		 491 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  27.05 
 
 		 518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  30.2 
 
 		 494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  28.79 
 
 		 475 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  28.29 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  28.29 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  28.29 
 
 		 475 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  28.29 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  28.29 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  28.29 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  28.29 
 
 		 475 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  28.29 
 
 		 475 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  28.62 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  28.62 
 
 		 476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>