245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0178 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 417 aa  860    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  48.49 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  44.3 
 
 		 525 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  45.92 
 
 		 512 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  45.92 
 
 		 486 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  46.01 
 
 		 554 aa  342  9e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  44.29 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  45.62 
 
 		 531 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  41.69 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  43.63 
 
 		 443 aa  312  6.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  43.96 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  38.5 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  40.26 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  39.84 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  41.16 
 
 		 473 aa  302  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  40.61 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  42.69 
 
 		 443 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  43.14 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  39.88 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  41.37 
 
 		 462 aa  286  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  41.09 
 
 		 493 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  39.88 
 
 		 479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  42.54 
 
 		 378 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  38.67 
 
 		 474 aa  282  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  40.39 
 
 		 501 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  37.97 
 
 		 434 aa  282  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  40 
 
 		 523 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  37.5 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  44.12 
 
 		 398 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  39.37 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  43.15 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  35.89 
 
 		 445 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  41.55 
 
 		 361 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  42.66 
 
 		 374 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  38.98 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  35.89 
 
 		 545 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  40.19 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  38.36 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  41.11 
 
 		 446 aa  223  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  33.82 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  40.85 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  39.73 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  36.04 
 
 		 451 aa  222  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  36.74 
 
 		 425 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  35.93 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  32.76 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  33.86 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  38.59 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  29.18 
 
 		 532 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  27.81 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  28.47 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  27.93 
 
 		 548 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  30.05 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  29.91 
 
 		 630 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  27.4 
 
 		 420 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  29.54 
 
 		 535 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  30.4 
 
 		 495 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  29.75 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  29.49 
 
 		 640 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  27.73 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  29.77 
 
 		 495 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  26.97 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  29.77 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  29.13 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  29.77 
 
 		 510 aa  159  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  29.23 
 
 		 530 aa  159  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  28.87 
 
 		 513 aa  159  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  28.57 
 
 		 475 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 475 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  28.57 
 
 		 475 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 475 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  28.89 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  28.57 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  28.47 
 
 		 485 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 475 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  27.45 
 
 		 453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  29.22 
 
 		 506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  28.96 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  28.57 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  28.3 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  29.12 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  27.45 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  28.43 
 
 		 518 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  29.03 
 
 		 480 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  27.86 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  27.82 
 
 		 492 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  29.31 
 
 		 520 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  28.49 
 
 		 518 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  29.05 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  27.49 
 
 		 492 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  27.78 
 
 		 457 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  28.21 
 
 		 519 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>