240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3111 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  100 
 
 		 361 aa  703    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  52.82 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  43.89 
 
 		 503 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  48.79 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  42.57 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  49.34 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  44.94 
 
 		 525 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  52.82 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  48.85 
 
 		 443 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  45.27 
 
 		 531 aa  259  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  42.76 
 
 		 512 aa  258  9e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  42.76 
 
 		 486 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  46.25 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  49.16 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  50.87 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  47.45 
 
 		 545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  50 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  44.76 
 
 		 554 aa  252  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  48.95 
 
 		 442 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  50.17 
 
 		 428 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  41.55 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  43.93 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  45.03 
 
 		 523 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  50.52 
 
 		 403 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  45.95 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  41.67 
 
 		 417 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  41.18 
 
 		 494 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  41.2 
 
 		 456 aa  235  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  44.54 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  48.57 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  48.06 
 
 		 493 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  35.56 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  37.9 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  43.88 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  40.7 
 
 		 459 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  45.39 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  44.12 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  41.21 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  41.64 
 
 		 445 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  41.84 
 
 		 446 aa  211  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  38.38 
 
 		 462 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  40.07 
 
 		 467 aa  206  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  36.09 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  41.96 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  42.48 
 
 		 419 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  38.83 
 
 		 504 aa  195  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  40.92 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  39.2 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  33.94 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30.07 
 
 		 532 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  29.32 
 
 		 531 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  30.26 
 
 		 510 aa  146  6e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  33.58 
 
 		 495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  32.84 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  33.85 
 
 		 492 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  33.21 
 
 		 495 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  32.84 
 
 		 495 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  34.5 
 
 		 492 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  34.52 
 
 		 492 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  28.87 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  31.85 
 
 		 548 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  35.09 
 
 		 424 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  34.52 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  34.74 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  34.52 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  31.14 
 
 		 530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  29.19 
 
 		 535 aa  133  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  33.83 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  32.92 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  28.52 
 
 		 630 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  34.58 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  32.51 
 
 		 640 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  31.45 
 
 		 518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  30.28 
 
 		 520 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  27.21 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  26.6 
 
 		 626 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  31.1 
 
 		 520 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  27.64 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  28.23 
 
 		 612 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  27.78 
 
 		 522 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  31.37 
 
 		 515 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  35.52 
 
 		 479 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  32.01 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  27.49 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  27.49 
 
 		 518 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  31.84 
 
 		 494 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  31.56 
 
 		 501 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  29.55 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  31.6 
 
 		 476 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  28.72 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  28.72 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  32.23 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  28.72 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  28.72 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  31.23 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  30.48 
 
 		 475 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  31.23 
 
 		 476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  30.42 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  30.48 
 
 		 475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  30.21 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>