247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0396 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  818    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  52.53 
 
 
525 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  52.94 
 
 
503 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  53.76 
 
 
554 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  49.03 
 
 
486 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  49.03 
 
 
512 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  46.34 
 
 
428 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  47.56 
 
 
531 aa  346  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  49.85 
 
 
462 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  48.55 
 
 
443 aa  341  1e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  46.13 
 
 
459 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  46.36 
 
 
456 aa  333  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  44.19 
 
 
448 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  44.89 
 
 
434 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  44.51 
 
 
501 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  39.59 
 
 
417 aa  318  9e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  40.61 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  42.33 
 
 
443 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  41.38 
 
 
434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  42.12 
 
 
474 aa  303  5.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  42.51 
 
 
479 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  41.69 
 
 
473 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  39.95 
 
 
494 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  41.28 
 
 
364 aa  295  7e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  38.95 
 
 
442 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  39.84 
 
 
378 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  40.65 
 
 
493 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  36.87 
 
 
386 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  36.2 
 
 
445 aa  266  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  37.02 
 
 
523 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  40.82 
 
 
398 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  36.8 
 
 
431 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  36.03 
 
 
403 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  42.6 
 
 
374 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  39.8 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  41.28 
 
 
391 aa  243  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  38.53 
 
 
451 aa  239  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  36.26 
 
 
366 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  36.15 
 
 
545 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  39.3 
 
 
361 aa  236  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  33.71 
 
 
504 aa  235  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  38.89 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  37.54 
 
 
390 aa  233  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  32.03 
 
 
425 aa  224  2e-57  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  40.13 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  39.8 
 
 
467 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  37.25 
 
 
419 aa  216  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  32.97 
 
 
428 aa  210  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  37.19 
 
 
403 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  31.14 
 
 
532 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  31.3 
 
 
531 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  29.64 
 
 
453 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  29.94 
 
 
491 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  31.31 
 
 
495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  29.57 
 
 
495 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  29.57 
 
 
495 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  30.7 
 
 
495 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  26.3 
 
 
470 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  30.61 
 
 
492 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  30.7 
 
 
492 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  30 
 
 
492 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  28.37 
 
 
453 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  29.21 
 
 
530 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  30.25 
 
 
640 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  30.99 
 
 
424 aa  143  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  29.01 
 
 
420 aa  143  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  26.11 
 
 
475 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  26.11 
 
 
475 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  33.21 
 
 
491 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  26.11 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  26.11 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  26.11 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  27.81 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  27.81 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  27.81 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  26.11 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  26.11 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  26.11 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  27.81 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  30.37 
 
 
504 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  26.11 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  29.26 
 
 
612 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  28.12 
 
 
535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  27.81 
 
 
476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  28.65 
 
 
548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  27.65 
 
 
485 aa  140  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  31.52 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  27.33 
 
 
403 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1993  protein of unknown function DUF195  32.64 
 
 
479 aa  138  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  28.57 
 
 
498 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  28.57 
 
 
501 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  27.08 
 
 
510 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  30.53 
 
 
527 aa  136  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  28.26 
 
 
407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  27.19 
 
 
518 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  27.19 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  27.19 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  27.19 
 
 
519 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  29.13 
 
 
457 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  27.19 
 
 
519 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>