195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4571 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  860    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  49.26 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  43.6 
 
 
504 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  39.22 
 
 
445 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  39.14 
 
 
417 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  39.9 
 
 
512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  39.9 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  45.21 
 
 
525 aa  254  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  40.35 
 
 
503 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  46.41 
 
 
428 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  39.9 
 
 
442 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  40.87 
 
 
531 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  40.58 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0971  protein of unknown function DUF195  44.98 
 
 
479 aa  246  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000421648 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  40.71 
 
 
459 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  42.72 
 
 
364 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  38.59 
 
 
494 aa  239  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  36.8 
 
 
402 aa  239  9e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  40.89 
 
 
378 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  42.02 
 
 
448 aa  237  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  42.68 
 
 
462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  40.38 
 
 
434 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  37.93 
 
 
386 aa  233  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  45.26 
 
 
374 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  38.86 
 
 
493 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  39.43 
 
 
501 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  41.37 
 
 
366 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  35.01 
 
 
443 aa  218  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  40.26 
 
 
554 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  35.93 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  37.72 
 
 
474 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  38.01 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  39.09 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  38.83 
 
 
523 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  38.59 
 
 
434 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  38.73 
 
 
398 aa  209  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  37.58 
 
 
545 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  34.7 
 
 
446 aa  203  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  35.26 
 
 
473 aa  203  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  36.81 
 
 
467 aa  202  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  38.41 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  38.98 
 
 
387 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  36.95 
 
 
399 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  37.58 
 
 
419 aa  189  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  39.2 
 
 
361 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  35.81 
 
 
391 aa  186  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  34.86 
 
 
475 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  34.86 
 
 
475 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  34.86 
 
 
475 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  34.86 
 
 
475 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  34.86 
 
 
475 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  34.86 
 
 
475 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  34.86 
 
 
475 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  34.86 
 
 
475 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  35.17 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  35.17 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  35.17 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  36.39 
 
 
475 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  35.17 
 
 
476 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  35.17 
 
 
476 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  29.7 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  36.39 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  34.86 
 
 
485 aa  173  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  33.63 
 
 
424 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  35.37 
 
 
518 aa  166  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  34.81 
 
 
501 aa  166  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  35.37 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  33.04 
 
 
420 aa  162  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  37.22 
 
 
504 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  32.11 
 
 
531 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  34.9 
 
 
513 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  33.33 
 
 
548 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  30.43 
 
 
532 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  28.98 
 
 
522 aa  159  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  37.16 
 
 
403 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  34 
 
 
501 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  34 
 
 
501 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  33.14 
 
 
640 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  34 
 
 
501 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  35.77 
 
 
515 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  30.18 
 
 
612 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  34.01 
 
 
500 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  33.53 
 
 
492 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  33.84 
 
 
492 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  31.7 
 
 
480 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  30.19 
 
 
519 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  30.19 
 
 
519 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  30.77 
 
 
448 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  30.19 
 
 
519 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  33.23 
 
 
492 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  29.27 
 
 
498 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  30.19 
 
 
519 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  30.19 
 
 
518 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  29.19 
 
 
498 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  30.5 
 
 
518 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  36.23 
 
 
491 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  34.49 
 
 
491 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  33.33 
 
 
453 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  34.84 
 
 
495 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  30.03 
 
 
507 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>