More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0023 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0023  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  50.42 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  50.85 
 
 		 258 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  52.12 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 243 aa  252  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  50.85 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  50.85 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  49.37 
 
 		 243 aa  248  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  48.32 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  49.15 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  50.42 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  48.32 
 
 		 244 aa  245  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  50.42 
 
 		 267 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  48.76 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  48.95 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  49.15 
 
 		 244 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  50.86 
 
 		 277 aa  242  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  47.9 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  50.86 
 
 		 254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  48.54 
 
 		 244 aa  241  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  50.43 
 
 		 279 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  50 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1517  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 260 aa  239  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  48.48 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  47.9 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  48.47 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 		 336 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  49.17 
 
 		 271 aa  237  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  48.09 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  48.15 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  49.38 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  48.52 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  47.26 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  48.47 
 
 		 263 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  47.28 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  48.51 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  46.86 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  48.32 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 		 241 aa  234  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  49.16 
 
 		 241 aa  234  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 240 aa  234  6e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  47.7 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  47.7 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  49.14 
 
 		 242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  49.15 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  48.28 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  49.78 
 
 		 258 aa  232  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  46.38 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  48.31 
 
 		 247 aa  232  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  47.26 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0742  ABC transporter, ATP-binding protein  51.67 
 
 		 241 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0290801  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  48.09 
 
 		 249 aa  231  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  48.51 
 
 		 242 aa  231  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  47.93 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  47.92 
 
 		 243 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  47.48 
 
 		 242 aa  231  8.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  47.26 
 
 		 256 aa  231  9e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  47.03 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  47.13 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  49.35 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  48.71 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  49.37 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  48.26 
 
 		 259 aa  229  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  47.66 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  47.68 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  46.06 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  47.92 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0757  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  45.99 
 
 		 253 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  47.23 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  45.99 
 
 		 253 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  46.64 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  49.78 
 
 		 270 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  47.74 
 
 		 258 aa  228  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  47.46 
 
 		 311 aa  228  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  47.74 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  46.86 
 
 		 241 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  46.41 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  47.74 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  46.09 
 
 		 241 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  46.89 
 
 		 239 aa  228  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  48.48 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  47.6 
 
 		 239 aa  228  9e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  48.15 
 
 		 261 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  48.31 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1126  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 262 aa  227  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 		 332 aa  227  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  46.72 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.7 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>