More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1126 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1126  ABC transporter related protein  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  51.06 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0151  ABC transporter related  52.61 
 
 		 240 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.539843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  49.58 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  50.42 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  47.7 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  51.68 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  50.21 
 
 		 271 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  50.84 
 
 		 333 aa  251  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  51.27 
 
 		 239 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  51.27 
 
 		 317 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0679  ABC transporter related  50.42 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  48.76 
 
 		 243 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 277 aa  248  8e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.84 
 
 		 336 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  50.64 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  49.58 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  50.64 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  52.19 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  51.06 
 
 		 249 aa  247  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  51.49 
 
 		 316 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  52.19 
 
 		 317 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  48.74 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  48.94 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 		 245 aa  246  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  49.79 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  49.36 
 
 		 263 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2580  ABC transporter-like protein  48.95 
 
 		 256 aa  242  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0588  ABC transporter related  48.09 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0166343  hitchhiker  0.0000000000281481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  46.72 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  50.21 
 
 		 251 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  50.21 
 
 		 261 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 		 245 aa  242  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  46.03 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  48.94 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  48.7 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  50.85 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 277 aa  239  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  45.61 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  49.13 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  50 
 
 		 283 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  50 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  48.09 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  49.15 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  49.79 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  50 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  48.12 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 244 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  46.81 
 
 		 243 aa  238  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 254 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  49.58 
 
 		 289 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  48.94 
 
 		 250 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  46.78 
 
 		 239 aa  238  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  49.16 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  45.61 
 
 		 244 aa  237  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  48.09 
 
 		 258 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  47.88 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  47.66 
 
 		 264 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1517  ABC transporter related protein  47.68 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  49.58 
 
 		 321 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  46.03 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  46.03 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  48.12 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.94 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  50.42 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  48.95 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  47.68 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  48.51 
 
 		 310 aa  234  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  49.36 
 
 		 258 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1982  ABC-transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  49.57 
 
 		 267 aa  234  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  48.31 
 
 		 241 aa  234  8e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  46.86 
 
 		 241 aa  234  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 245 aa  234  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  49.36 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  47.68 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  46.84 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  45.61 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  48.12 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  48.73 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  46.41 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  47.23 
 
 		 240 aa  232  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  49.36 
 
 		 270 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  46.38 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 241 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4208  ABC transporter related  45.76 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216792  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  48.33 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.88 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.88 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.88 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.88 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.88 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  48.09 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  47.88 
 
 		 241 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>