More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13820 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13820  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  812    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  34.17 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 
785 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.14 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  38.05 
 
 
334 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  33.02 
 
 
271 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.34 
 
 
352 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  34.78 
 
 
199 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.96 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
826 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  34.96 
 
 
387 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06630  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.59 
 
 
547 aa  60.1  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.630482  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.31 
 
 
271 aa  60.1  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  29.27 
 
 
323 aa  59.7  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  32.74 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1793  peptidase M23B  32.04 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.532041  normal  0.0360441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  32.35 
 
 
271 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  32.08 
 
 
491 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  32.41 
 
 
533 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  32.08 
 
 
482 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  30.61 
 
 
447 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  30.61 
 
 
447 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.45 
 
 
554 aa  57  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  31.86 
 
 
340 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  29.7 
 
 
288 aa  57  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  33.91 
 
 
458 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  33.91 
 
 
348 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  33.96 
 
 
291 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
300 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  32.08 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1660  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
232 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014309  hitchhiker  0.00126456 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  37.38 
 
 
300 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  37.04 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  33.96 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  33.91 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  30 
 
 
250 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  26.97 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  27.56 
 
 
288 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  30 
 
 
250 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  30 
 
 
250 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  30 
 
 
250 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  33.96 
 
 
292 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.61 
 
 
312 aa  54.7  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.61 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  30 
 
 
248 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  32.43 
 
 
280 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4161  Peptidase M23  33 
 
 
261 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000379342  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  29.09 
 
 
250 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  33 
 
 
241 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  28.18 
 
 
251 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  30.84 
 
 
302 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  29.06 
 
 
443 aa  54.3  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  27.87 
 
 
195 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  28.18 
 
 
251 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  28.18 
 
 
251 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  28.18 
 
 
251 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  28.18 
 
 
251 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  28.18 
 
 
251 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  28.18 
 
 
251 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  31.86 
 
 
339 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  34.26 
 
 
425 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  35.19 
 
 
229 aa  53.5  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.97 
 
 
301 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.31 
 
 
274 aa  53.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  30.36 
 
 
340 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  30.17 
 
 
348 aa  53.1  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  30.36 
 
 
340 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  26.57 
 
 
286 aa  53.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  30.3 
 
 
216 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  32.69 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  33.04 
 
 
316 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  27.27 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  34.26 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  31.43 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  33.66 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  35.94 
 
 
313 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.64 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  30.77 
 
 
470 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  30.77 
 
 
509 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0084  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
255 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  32.08 
 
 
284 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  33.04 
 
 
332 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  30.77 
 
 
512 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  32.69 
 
 
311 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 
471 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  30.77 
 
 
472 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  33.66 
 
 
327 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  28.21 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  27.27 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  33.66 
 
 
327 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  30.09 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  31.19 
 
 
423 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  28.45 
 
 
399 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  24.57 
 
 
283 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  28.3 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1573  peptidase M23B  31.09 
 
 
348 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0724492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  30.09 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  29.31 
 
 
735 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  31 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  33.66 
 
 
327 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>