More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10870 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  100 
 
 
560 aa  1130    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.64 
 
 
553 aa  543  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  47.45 
 
 
556 aa  529  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  47.09 
 
 
556 aa  529  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  54.31 
 
 
554 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  48.62 
 
 
553 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.15 
 
 
552 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  46.65 
 
 
555 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  47.79 
 
 
550 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  47.6 
 
 
550 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  47.43 
 
 
550 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  47.6 
 
 
550 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  42.94 
 
 
558 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  42.75 
 
 
561 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  43.22 
 
 
561 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  42.12 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  42.12 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  41.47 
 
 
558 aa  452  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  42.11 
 
 
558 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  41.47 
 
 
561 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  45.33 
 
 
561 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  38.29 
 
 
549 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.1 
 
 
546 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.1 
 
 
546 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.04 
 
 
576 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  38.94 
 
 
580 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.21 
 
 
547 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.41 
 
 
572 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  36.92 
 
 
542 aa  361  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  36.75 
 
 
570 aa  357  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  35.63 
 
 
596 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.56 
 
 
558 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.57 
 
 
552 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.38 
 
 
552 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  36.01 
 
 
568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.28 
 
 
546 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  35.65 
 
 
575 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.73 
 
 
550 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.62 
 
 
557 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  34.19 
 
 
549 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.12 
 
 
562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.45 
 
 
545 aa  271  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  34.53 
 
 
547 aa  267  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  30.07 
 
 
559 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  30.07 
 
 
559 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.84 
 
 
558 aa  252  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62095  pyruvate decarboxylase (PDC6) (PDC3)  31.46 
 
 
623 aa  228  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.45 
 
 
551 aa  225  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.3 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2896  indole-3-pyruvate decarboxylase (Indolepyruvatedecarboxylase)  36.26 
 
 
274 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  0.207962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  28.31 
 
 
541 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  29.82 
 
 
553 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  29.84 
 
 
543 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  30.5 
 
 
543 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.56 
 
 
543 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  32.49 
 
 
713 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  29.14 
 
 
545 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  28.89 
 
 
555 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.48 
 
 
572 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  27.95 
 
 
542 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  26.16 
 
 
540 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  27.65 
 
 
572 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03866  thiamine pyrophosphate-binding domain protein  24.65 
 
 
600 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.35 
 
 
561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6051  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.27 
 
 
393 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221657  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  27.16 
 
 
547 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  27.81 
 
 
547 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  26.95 
 
 
547 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  26.95 
 
 
547 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  26.95 
 
 
547 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  25.99 
 
 
548 aa  108  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.77 
 
 
620 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  26.58 
 
 
547 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  26.58 
 
 
547 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.52 
 
 
586 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.87 
 
 
644 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0171  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.82 
 
 
599 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3640  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.33 
 
 
608 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.63 
 
 
555 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  28.63 
 
 
536 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.89 
 
 
596 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  25.26 
 
 
552 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  25.44 
 
 
620 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.42 
 
 
576 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  26.45 
 
 
566 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.67 
 
 
562 aa  100  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  28.05 
 
 
598 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  25.98 
 
 
547 aa  100  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  26.95 
 
 
547 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3635  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.78 
 
 
603 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.88 
 
 
546 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  24.96 
 
 
619 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  24.96 
 
 
619 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  24.96 
 
 
619 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.85 
 
 
659 aa  99.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  24.32 
 
 
550 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  24.32 
 
 
550 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  24.33 
 
 
550 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  25.14 
 
 
583 aa  99  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25 
 
 
566 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>