More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2331 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  59.71 
 
 
542 aa  651    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  66.32 
 
 
572 aa  719    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  100 
 
 
555 aa  1123    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  60.79 
 
 
540 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  58.2 
 
 
553 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  55.09 
 
 
543 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  54.28 
 
 
543 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  54.46 
 
 
543 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  54.36 
 
 
545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  36.82 
 
 
541 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.25 
 
 
557 aa  303  5.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.33 
 
 
545 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  33.99 
 
 
547 aa  296  5e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  35.04 
 
 
549 aa  277  3e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.89 
 
 
546 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.12 
 
 
552 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.12 
 
 
552 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.33 
 
 
550 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.41 
 
 
551 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  24.26 
 
 
561 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  24.28 
 
 
561 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  24.26 
 
 
561 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  24.2 
 
 
558 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  24.32 
 
 
561 aa  187  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  23.99 
 
 
558 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  24.54 
 
 
561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  24.38 
 
 
558 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  28.68 
 
 
560 aa  176  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  27.51 
 
 
580 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  27.29 
 
 
568 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  23.9 
 
 
549 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.55 
 
 
547 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.33 
 
 
553 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  25.55 
 
 
575 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  24.96 
 
 
542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.84 
 
 
572 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.37 
 
 
562 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  27.55 
 
 
555 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.4 
 
 
558 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.67 
 
 
561 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.69 
 
 
546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.69 
 
 
546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.31 
 
 
586 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.67 
 
 
576 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  25.84 
 
 
559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  25.31 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.44 
 
 
552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  25.84 
 
 
559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  23.55 
 
 
713 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  25.27 
 
 
556 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.09 
 
 
553 aa  145  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  24.68 
 
 
572 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.37 
 
 
550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.37 
 
 
550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.37 
 
 
550 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.37 
 
 
550 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  22.99 
 
 
545 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.15 
 
 
558 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  23.67 
 
 
550 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.82 
 
 
572 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.27 
 
 
572 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0984  thiamine pyrophosphate protein central region  26.01 
 
 
553 aa  134  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.351073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  23.67 
 
 
550 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.05 
 
 
559 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.18 
 
 
572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  25.32 
 
 
560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.73 
 
 
572 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.82 
 
 
572 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.35 
 
 
526 aa  130  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.13 
 
 
593 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.13 
 
 
575 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.13 
 
 
575 aa  130  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.13 
 
 
572 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.75 
 
 
625 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.31 
 
 
572 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.35 
 
 
560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  27.11 
 
 
620 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25 
 
 
587 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.18 
 
 
573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.37 
 
 
618 aa  128  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  21.71 
 
 
596 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.11 
 
 
572 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.83 
 
 
573 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.14 
 
 
573 aa  127  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.88 
 
 
561 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  23.23 
 
 
547 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.64 
 
 
572 aa  127  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.56 
 
 
602 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.11 
 
 
572 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  25.5 
 
 
556 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.81 
 
 
571 aa  126  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.96 
 
 
573 aa  126  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.95 
 
 
570 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.56 
 
 
572 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.03 
 
 
619 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  23.67 
 
 
587 aa  126  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.33 
 
 
571 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.03 
 
 
619 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.11 
 
 
572 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.03 
 
 
619 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>