More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4114 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  100 
 
 
541 aa  1115    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  44.32 
 
 
547 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.34 
 
 
545 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  43.04 
 
 
557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.25 
 
 
552 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  42.38 
 
 
549 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.25 
 
 
552 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  39.53 
 
 
543 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.84 
 
 
546 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  39.42 
 
 
543 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  38.83 
 
 
543 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  39.36 
 
 
545 aa  340  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  36.4 
 
 
542 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  37.7 
 
 
553 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  36.66 
 
 
555 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.54 
 
 
550 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  36.33 
 
 
540 aa  317  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  36.51 
 
 
572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.68 
 
 
572 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  30.14 
 
 
561 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  30.32 
 
 
561 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  30.14 
 
 
558 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  29.78 
 
 
561 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  29.78 
 
 
561 aa  269  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  29.64 
 
 
558 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  30.02 
 
 
561 aa  266  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  28.9 
 
 
558 aa  263  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.93 
 
 
549 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.38 
 
 
551 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.27 
 
 
546 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.27 
 
 
546 aa  240  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  26.33 
 
 
580 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.6 
 
 
558 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  27.92 
 
 
559 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.97 
 
 
547 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  27.92 
 
 
559 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.94 
 
 
553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  26.27 
 
 
542 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.87 
 
 
586 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.42 
 
 
576 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  27.75 
 
 
568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.24 
 
 
562 aa  214  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  27.4 
 
 
556 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  27.21 
 
 
556 aa  213  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  26.73 
 
 
555 aa  213  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.75 
 
 
553 aa  208  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.34 
 
 
552 aa  203  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  28.36 
 
 
560 aa  200  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  27.27 
 
 
570 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  26.64 
 
 
575 aa  198  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.27 
 
 
561 aa  191  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  25.68 
 
 
550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.75 
 
 
572 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  27.04 
 
 
596 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  25.5 
 
 
550 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  25.5 
 
 
550 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  25.5 
 
 
550 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.05 
 
 
558 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.36 
 
 
557 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0984  thiamine pyrophosphate protein central region  25.9 
 
 
553 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.351073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  26.09 
 
 
551 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1986  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.36 
 
 
549 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0220  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.98 
 
 
580 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  23.26 
 
 
713 aa  164  6e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0587  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  24.15 
 
 
531 aa  163  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0776726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  25.05 
 
 
547 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  24.86 
 
 
547 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  25.37 
 
 
552 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1175  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.56 
 
 
526 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.312541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.45 
 
 
561 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1934  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.51 
 
 
580 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.97 
 
 
526 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  24.3 
 
 
567 aa  156  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0515  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  27.16 
 
 
580 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0291729 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  25.92 
 
 
547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.18 
 
 
566 aa  153  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  24.91 
 
 
546 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  25.52 
 
 
556 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.18 
 
 
571 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.26 
 
 
557 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  24.31 
 
 
547 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  24.31 
 
 
547 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.04 
 
 
535 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  26.42 
 
 
583 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  24.31 
 
 
547 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  27.45 
 
 
587 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  25.71 
 
 
549 aa  151  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.62 
 
 
572 aa  151  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  26.87 
 
 
587 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  24.13 
 
 
547 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.83 
 
 
569 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.56 
 
 
549 aa  150  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.25 
 
 
567 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.95 
 
 
573 aa  150  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  24.18 
 
 
547 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.29 
 
 
593 aa  150  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3125  acetolactate synthase, large subunit  25.18 
 
 
564 aa  150  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.2 
 
 
554 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  24.31 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  24.31 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>