More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0858 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  100 
 
 
556 aa  1149    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  92.99 
 
 
556 aa  1073    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  74.86 
 
 
553 aa  870    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  47.45 
 
 
560 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.42 
 
 
552 aa  478  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.86 
 
 
553 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  43.04 
 
 
555 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  41.94 
 
 
561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  41.73 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  41.55 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  41.34 
 
 
558 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  41.19 
 
 
561 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  42.29 
 
 
558 aa  452  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  41.19 
 
 
561 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  41.91 
 
 
558 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  42.6 
 
 
550 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  42.42 
 
 
550 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  42.42 
 
 
550 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  42.42 
 
 
550 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  41.05 
 
 
549 aa  423  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  42.19 
 
 
554 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.63 
 
 
546 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.63 
 
 
546 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.99 
 
 
561 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  37.36 
 
 
580 aa  362  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.1 
 
 
572 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  37.5 
 
 
568 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  34.18 
 
 
570 aa  327  4.0000000000000003e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.01 
 
 
576 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.08 
 
 
558 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.72 
 
 
547 aa  320  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  33.63 
 
 
542 aa  320  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  32.72 
 
 
596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.46 
 
 
550 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.8 
 
 
552 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  34.04 
 
 
575 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.63 
 
 
552 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  31.26 
 
 
713 aa  294  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.57 
 
 
546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62095  pyruvate decarboxylase (PDC6) (PDC3)  32.72 
 
 
623 aa  263  8.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.33 
 
 
557 aa  249  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.78 
 
 
558 aa  243  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.89 
 
 
562 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  29.7 
 
 
547 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.11 
 
 
545 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  30.15 
 
 
559 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  29.96 
 
 
559 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.7 
 
 
586 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  28 
 
 
541 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2896  indole-3-pyruvate decarboxylase (Indolepyruvatedecarboxylase)  38.35 
 
 
274 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  0.207962 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.61 
 
 
551 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  28.32 
 
 
549 aa  196  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  27.02 
 
 
543 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  27.4 
 
 
543 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.55 
 
 
543 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  25.75 
 
 
542 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.01 
 
 
545 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  25.51 
 
 
572 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  25.59 
 
 
553 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  25.41 
 
 
540 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  25.31 
 
 
555 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  26.38 
 
 
572 aa  140  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03866  thiamine pyrophosphate-binding domain protein  24.82 
 
 
600 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0587  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  21.88 
 
 
531 aa  103  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0776726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.38 
 
 
559 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  23.98 
 
 
562 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.04 
 
 
581 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.33 
 
 
586 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.05 
 
 
561 aa  100  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  23.24 
 
 
546 aa  98.6  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.53 
 
 
581 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.56 
 
 
584 aa  98.2  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.36 
 
 
566 aa  97.8  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4081  thiamine pyrophosphate protein central region  23.26 
 
 
583 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  25 
 
 
541 aa  97.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  21.95 
 
 
548 aa  97.1  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  23.7 
 
 
550 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  25 
 
 
564 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  23.42 
 
 
550 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.65 
 
 
566 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  22.74 
 
 
562 aa  93.6  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  23.25 
 
 
546 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  23.44 
 
 
546 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  23.25 
 
 
546 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  23.44 
 
 
546 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  23.25 
 
 
546 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  23.44 
 
 
546 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.2 
 
 
562 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3614  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  23.73 
 
 
557 aa  93.2  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  23.25 
 
 
546 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0688  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.33 
 
 
586 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  22.81 
 
 
566 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.1 
 
 
566 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6051  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.3 
 
 
393 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221657  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1175  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  22.08 
 
 
526 aa  92  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.312541 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.39 
 
 
566 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.84 
 
 
560 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  22.76 
 
 
563 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  22.3 
 
 
547 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  23.52 
 
 
557 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>