More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B2896 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2896  indole-3-pyruvate decarboxylase (Indolepyruvatedecarboxylase)  100 
 
 
274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  0.207962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  92.34 
 
 
558 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  83.21 
 
 
561 aa  484  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  83.21 
 
 
561 aa  484  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  83.21 
 
 
561 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  83.21 
 
 
558 aa  484  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  82.12 
 
 
561 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  82.12 
 
 
561 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  82.12 
 
 
558 aa  474  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  46.32 
 
 
549 aa  236  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.18 
 
 
546 aa  225  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.18 
 
 
546 aa  225  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.43 
 
 
553 aa  216  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.23 
 
 
553 aa  205  8e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  38.21 
 
 
550 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  38.21 
 
 
550 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  38.21 
 
 
550 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  38.35 
 
 
556 aa  202  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  37.86 
 
 
550 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.86 
 
 
552 aa  202  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  37.23 
 
 
580 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  36.26 
 
 
560 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  37.41 
 
 
555 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  36.5 
 
 
556 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.46 
 
 
558 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.59 
 
 
546 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  41.15 
 
 
554 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.47 
 
 
552 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.47 
 
 
552 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.73 
 
 
561 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  35.04 
 
 
568 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.58 
 
 
550 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  35.19 
 
 
596 aa  156  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  32.51 
 
 
713 aa  155  9e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  34.16 
 
 
570 aa  151  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  34.59 
 
 
542 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  41.95 
 
 
575 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.33 
 
 
562 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.39 
 
 
557 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.18 
 
 
576 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.59 
 
 
572 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  31.99 
 
 
559 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  31.99 
 
 
559 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.68 
 
 
558 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.82 
 
 
547 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  26.2 
 
 
547 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.64 
 
 
545 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  24.06 
 
 
549 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62095  pyruvate decarboxylase (PDC6) (PDC3)  35.82 
 
 
623 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27 
 
 
586 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  27.03 
 
 
541 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.1 
 
 
551 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.88 
 
 
572 aa  85.5  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6051  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.86 
 
 
393 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221657  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.53 
 
 
545 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  25.17 
 
 
543 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  24.22 
 
 
553 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  24.83 
 
 
542 aa  65.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  30.95 
 
 
576 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  24.86 
 
 
575 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  23.45 
 
 
540 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  26.49 
 
 
543 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  23.78 
 
 
572 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.38 
 
 
499 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  25.17 
 
 
543 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1799  benzoylformate decarboxylase  28.35 
 
 
542 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.28 
 
 
572 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  22.52 
 
 
555 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.62 
 
 
574 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.86 
 
 
574 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.85 
 
 
586 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  25.12 
 
 
564 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.63 
 
 
583 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  28 
 
 
572 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.63 
 
 
583 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.04 
 
 
593 aa  59.3  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  26.62 
 
 
561 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.04 
 
 
575 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.04 
 
 
575 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  29.37 
 
 
545 aa  58.9  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.5 
 
 
555 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1037  acetolactate synthase, large subunit  28.03 
 
 
551 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0844069  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.82 
 
 
588 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02606  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.09 
 
 
573 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.08 
 
 
555 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0451  acetolactate synthase, large subunit  21.28 
 
 
549 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  28.57 
 
 
560 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3699  benzoylformate decarboxylase  26.28 
 
 
540 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637419  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  28.65 
 
 
554 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.93 
 
 
584 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  31.37 
 
 
567 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.43 
 
 
566 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2248  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.57 
 
 
571 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.39 
 
 
548 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6666  benzoylformate decarboxylase  28.32 
 
 
540 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2189  thiamine pyrophosphate protein central region  29.46 
 
 
585 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142127  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002041  acetolactate synthase large subunit  25.39 
 
 
421 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.17 
 
 
596 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  23.86 
 
 
542 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3894  acetolactate synthase catalytic subunit  32.08 
 
 
566 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>