More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4795 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4795  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  100 
 
 
554 aa  1082    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.781269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10870  pyruvate or indole-3-pyruvate decarboxylase pdc  54.31 
 
 
560 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0234089 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  46.69 
 
 
555 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.32 
 
 
553 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  43.67 
 
 
556 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.03 
 
 
552 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.16 
 
 
553 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  41.99 
 
 
556 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  0.0000449891 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  40.39 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  40.22 
 
 
561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  40.64 
 
 
558 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  40.04 
 
 
561 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  40.04 
 
 
561 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  45.89 
 
 
550 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  45.71 
 
 
550 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  46.07 
 
 
550 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  39.89 
 
 
558 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  40.82 
 
 
558 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  45.89 
 
 
550 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  40.61 
 
 
561 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000921209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  42.73 
 
 
561 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.16 
 
 
547 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  34.73 
 
 
549 aa  359  9e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.4 
 
 
546 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.4 
 
 
546 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  35.33 
 
 
542 aa  356  7.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  38.76 
 
 
580 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  36.91 
 
 
570 aa  343  7e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.27 
 
 
572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  33.45 
 
 
596 aa  327  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.98 
 
 
558 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  37.45 
 
 
568 aa  324  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.67 
 
 
552 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  35.67 
 
 
552 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.23 
 
 
576 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.73 
 
 
550 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.83 
 
 
546 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  33.39 
 
 
575 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  32.34 
 
 
713 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  34.46 
 
 
547 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.96 
 
 
557 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  38.4 
 
 
549 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.53 
 
 
545 aa  246  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  34.48 
 
 
558 aa  239  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  28.55 
 
 
559 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  28.55 
 
 
559 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.54 
 
 
562 aa  224  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62095  pyruvate decarboxylase (PDC6) (PDC3)  29.51 
 
 
623 aa  222  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.732507  normal  0.466164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2896  indole-3-pyruvate decarboxylase (Indolepyruvatedecarboxylase)  37 
 
 
274 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal  0.207962 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.86 
 
 
551 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  28.86 
 
 
541 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.45 
 
 
586 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  31.08 
 
 
553 aa  186  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  28.7 
 
 
543 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  31.86 
 
 
542 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  29.84 
 
 
543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  29.57 
 
 
543 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.57 
 
 
572 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  30.2 
 
 
555 aa  160  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  28.52 
 
 
540 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  28.81 
 
 
545 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  29.45 
 
 
572 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6051  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.16 
 
 
393 aa  104  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221657  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  24.95 
 
 
563 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03866  thiamine pyrophosphate-binding domain protein  23.4 
 
 
600 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  23.81 
 
 
548 aa  97.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3445  thiamine pyrophosphate protein  27.77 
 
 
596 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663093  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  22.97 
 
 
550 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0171  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.44 
 
 
599 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1025  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  24.61 
 
 
605 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3635  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.12 
 
 
603 aa  93.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.87 
 
 
557 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1376  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  23.17 
 
 
610 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.69 
 
 
557 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13507  acetolactate synthase large subunit ilvB2  25.79 
 
 
552 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1613  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.53 
 
 
558 aa  90.9  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.69 
 
 
551 aa  90.9  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  24.91 
 
 
547 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25.51 
 
 
552 aa  89.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  24.63 
 
 
557 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  25.28 
 
 
555 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  24.31 
 
 
546 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  25.85 
 
 
547 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  25.85 
 
 
547 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  24.63 
 
 
557 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  24.31 
 
 
546 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  25 
 
 
557 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.51 
 
 
547 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  25.19 
 
 
547 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  25.19 
 
 
547 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.33 
 
 
586 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  25.19 
 
 
547 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  24.63 
 
 
557 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  25 
 
 
547 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33590  thiamine pyrophosphate protein  26.3 
 
 
596 aa  87.4  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  24.41 
 
 
567 aa  87  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  25.14 
 
 
547 aa  87.4  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.04 
 
 
561 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  25.71 
 
 
547 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  26.72 
 
 
547 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>