More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1043 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  100 
 
 		 583 aa  1210    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  49.57 
 
 		 583 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  48.56 
 
 		 547 aa  563  1.0000000000000001e-159  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  44.55 
 
 		 547 aa  485  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  44.83 
 
 		 547 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  44.85 
 
 		 550 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  43.6 
 
 		 545 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  43.38 
 
 		 550 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  43.38 
 
 		 550 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  44.44 
 
 		 547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  42.47 
 
 		 545 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  43.68 
 
 		 547 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.64 
 
 		 554 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  38.12 
 
 		 544 aa  392  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  39.39 
 
 		 547 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  38.66 
 
 		 547 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  38.66 
 
 		 547 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  38.66 
 
 		 547 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  38.66 
 
 		 547 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  38.48 
 
 		 547 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  38.66 
 
 		 547 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  38.28 
 
 		 552 aa  372  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  38.29 
 
 		 547 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  35.9 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  38.6 
 
 		 546 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  37.97 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.98 
 
 		 547 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  36.61 
 
 		 548 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  36.23 
 
 		 563 aa  363  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  36.55 
 
 		 550 aa  363  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.9 
 
 		 526 aa  363  6e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  37.61 
 
 		 547 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  38.82 
 
 		 546 aa  362  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  37.43 
 
 		 547 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  36.18 
 
 		 550 aa  360  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  37.68 
 
 		 546 aa  359  7e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  36.33 
 
 		 556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  36.66 
 
 		 550 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  36.38 
 
 		 546 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  36.38 
 
 		 546 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  36.38 
 
 		 546 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  36.56 
 
 		 546 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  36.68 
 
 		 546 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  36.5 
 
 		 546 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  36.01 
 
 		 546 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  36.5 
 
 		 546 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  36.15 
 
 		 544 aa  349  7e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  36.5 
 
 		 546 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  36.5 
 
 		 546 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 550 aa  349  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  36.5 
 
 		 546 aa  349  8e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  36.31 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  36.31 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  36.31 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  36.31 
 
 		 546 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  37.18 
 
 		 558 aa  341  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  38.04 
 
 		 552 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.52 
 
 		 554 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 546 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  37.55 
 
 		 548 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  36.21 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  33.69 
 
 		 562 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  33.69 
 
 		 562 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  33.69 
 
 		 562 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  33.51 
 
 		 562 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  33.51 
 
 		 562 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  33.33 
 
 		 562 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  33.51 
 
 		 565 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  33.51 
 
 		 565 aa  302  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  33.51 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  33.33 
 
 		 565 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  32.44 
 
 		 554 aa  293  7e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  35.05 
 
 		 565 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  33.04 
 
 		 560 aa  290  4e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.21 
 
 		 552 aa  279  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  33.51 
 
 		 553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  30.7 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.47 
 
 		 556 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.47 
 
 		 561 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  30.5 
 
 		 560 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.84 
 
 		 576 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  33.09 
 
 		 559 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  29.29 
 
 		 558 aa  266  8e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.74 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0522  acetolactate synthase  32.62 
 
 		 561 aa  264  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.25 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.1 
 
 		 584 aa  263  4.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  30.85 
 
 		 554 aa  263  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  30.2 
 
 		 554 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  30.2 
 
 		 554 aa  263  6.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  31.47 
 
 		 559 aa  263  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  31.15 
 
 		 567 aa  263  8e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  31.71 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.76 
 
 		 554 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  31.03 
 
 		 559 aa  260  6e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.23 
 
 		 553 aa  260  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  31.2 
 
 		 587 aa  259  9e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.85 
 
 		 561 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.89 
 
 		 554 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  30.59 
 
 		 562 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>