More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3360 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  55.88 
 
 		 550 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  61.5 
 
 		 547 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  61.5 
 
 		 547 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  59.16 
 
 		 546 aa  675    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  61.4 
 
 		 552 aa  698    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  100 
 
 		 552 aa  1141    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  58.97 
 
 		 546 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  58.97 
 
 		 546 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  58.42 
 
 		 546 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  60.96 
 
 		 551 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  58.97 
 
 		 546 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  59.16 
 
 		 546 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  61.5 
 
 		 547 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  59.01 
 
 		 546 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  59.16 
 
 		 546 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  60.07 
 
 		 550 aa  669    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  61.99 
 
 		 547 aa  711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  61.61 
 
 		 558 aa  681    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  59.85 
 
 		 550 aa  666    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  61.68 
 
 		 547 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  60.55 
 
 		 546 aa  691    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  59.34 
 
 		 546 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  61.68 
 
 		 547 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  60.22 
 
 		 563 aa  670    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  59.59 
 
 		 546 aa  656    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  56.23 
 
 		 550 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  58.24 
 
 		 546 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  61.06 
 
 		 548 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  59.19 
 
 		 546 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  61.86 
 
 		 547 aa  709    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  58.41 
 
 		 546 aa  685    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  61.31 
 
 		 547 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  58.06 
 
 		 546 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  60.98 
 
 		 547 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  57.69 
 
 		 550 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  59.19 
 
 		 546 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  61.16 
 
 		 547 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  61.76 
 
 		 547 aa  703    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  60.62 
 
 		 548 aa  654    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  59.19 
 
 		 546 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  62.57 
 
 		 556 aa  719    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  59.74 
 
 		 547 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  58.97 
 
 		 546 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  60.69 
 
 		 554 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  53.91 
 
 		 565 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  48.53 
 
 		 544 aa  524  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  42.94 
 
 		 545 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  43.07 
 
 		 550 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  42.99 
 
 		 550 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  42.99 
 
 		 550 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  40.3 
 
 		 547 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  42.54 
 
 		 547 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  42.49 
 
 		 547 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  42.43 
 
 		 545 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  39.78 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.7 
 
 		 554 aa  391  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.15 
 
 		 547 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  39.56 
 
 		 583 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  38.28 
 
 		 583 aa  372  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  36.86 
 
 		 547 aa  361  2e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  36.5 
 
 		 526 aa  334  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  34.07 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  33.64 
 
 		 562 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  33.64 
 
 		 562 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  33.64 
 
 		 562 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  33.88 
 
 		 565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  33.88 
 
 		 565 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  33.88 
 
 		 562 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  33.46 
 
 		 565 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  33.27 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  33.58 
 
 		 562 aa  318  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  33.63 
 
 		 567 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 546 aa  306  8.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  32.12 
 
 		 559 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  32.14 
 
 		 559 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  31.88 
 
 		 559 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  32.35 
 
 		 559 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  33.64 
 
 		 559 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  34.88 
 
 		 559 aa  297  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  33.46 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  32.48 
 
 		 567 aa  295  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  33.39 
 
 		 561 aa  292  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  31.56 
 
 		 560 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  31.99 
 
 		 548 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0522  acetolactate synthase  32.85 
 
 		 561 aa  280  5e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485583  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  31.47 
 
 		 554 aa  277  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  32.02 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  30.74 
 
 		 554 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  30.57 
 
 		 589 aa  270  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  30.57 
 
 		 589 aa  270  7e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  30.85 
 
 		 560 aa  268  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  29.62 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  29.62 
 
 		 554 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  32.55 
 
 		 622 aa  264  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.46 
 
 		 566 aa  262  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  31.63 
 
 		 569 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.09 
 
 		 567 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.39 
 
 		 563 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  30.94 
 
 		 566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  30.34 
 
 		 587 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>